Paket: vcfanno (0.3.5+ds-2)
vcfanno için bağlantılar
Debian Kaynakları:
- Hata Raporları
- Developer Information
- Debian Değişim Günlüğü
- Telif Hakkı Dosyası
- Debian Yama Takipçisi
vcfanno Kaynak Paketini İndir:
Geliştiriciler:
- Debian Med Packaging Team (QA Sayfası, Posta Arşivi)
- Andreas Tille (QA Sayfası)
- Nilesh Patra (QA Sayfası)
Dış Kaynaklar:
- Ana Sayfa [github.com]
Benzer paketler:
annotate a VCF with other VCFs/BEDs/tabixed files
Vcfanno allows you to quickly annotate your VCF with any number of INFO fields from any number of VCFs or BED files. It uses a simple conf file to allow the user to specify the source annotation files and fields and how they will be added to the info of the query VCF.
* For VCF, values are pulled by name from the INFO field with special cases of ID and FILTER to pull from those VCF columns. * For BED, values are pulled from (1-based) column number. * For BAM, depth (count), "mapq" and "seq" are currently supported.
Vcfanno is written in go and it supports custom user-scripts written in Lua. It can annotate more than 8000 variants per second with 34 annotations from 9 files on a modest laptop and over 30K variants per second using 12 processes on a server.
vcfanno ile İlgili Diğer Paketler
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.34)
- GNU C Library: Shared libraries
ayrıca şunun tarafından sağlanan bir sanal paket libc6-udeb
vcfanno indir
Mimari | Paket Boyutu | Kurulu Boyut | Dosyalar |
---|---|---|---|
amd64 | 2.249,3 kB | 6.683,0 kB | [dosya listesi] |
arm64 | 1.926,1 kB | 6.367,0 kB | [dosya listesi] |
armel | 1.923,4 kB | 6.531,0 kB | [dosya listesi] |
armhf | 1.915,6 kB | 6.491,0 kB | [dosya listesi] |
i386 | 2.071,5 kB | 6.520,0 kB | [dosya listesi] |
mips64el | 1.736,8 kB | 7.410,0 kB | [dosya listesi] |
ppc64el | 1.915,0 kB | 6.558,0 kB | [dosya listesi] |
riscv64 | 1.945,1 kB | 6.439,0 kB | [dosya listesi] |
s390x | 2.058,2 kB | 7.111,0 kB | [dosya listesi] |