tüm seçenekler
buster  ] [  bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Kaynak: jellyfish  ]

Paket: jellyfish (2.3.0-15 ve diğerleri)

jellyfish için bağlantılar

Screenshot

Debian Kaynakları:

jellyfish Kaynak Paketini İndir:

Geliştiriciler:

Dış Kaynaklar:

Benzer paketler:

count k-mers in DNA sequences

JELLYFISH is a tool for fast, memory-efficient counting of k-mers in DNA. A k-mer is a substring of length k, and counting the occurrences of all such substrings is a central step in many analyses of DNA sequence. JELLYFISH can count k-mers using an order of magnitude less memory and an order of magnitude faster than other k-mer counting packages by using an efficient encoding of a hash table and by exploiting the "compare-and-swap" CPU instruction to increase parallelism.

JELLYFISH is a command-line program that reads FASTA and multi-FASTA files containing DNA sequences. It outputs its k-mer counts in an binary format, which can be translated into a human-readable text format using the "jellyfish dump" command.

jellyfish ile İlgili Diğer Paketler

  • bağımlılıklar
  • tavsiye edilen
  • önerilen
  • enhances

jellyfish indir

Tüm mevcut mimariler için indir
Mimari Sürüm Paket Boyutu Kurulu Boyut Dosyalar
amd64 2.3.0-15+b3 770,4 kB2.475,0 kB [dosya listesi]
arm64 2.3.0-15+b3 688,6 kB2.379,0 kB [dosya listesi]
armel 2.3.0-15+b3 636,7 kB1.849,0 kB [dosya listesi]
armhf 2.3.0-15+b3 661,8 kB1.433,0 kB [dosya listesi]
i386 2.3.0-15+b3 754,7 kB2.261,0 kB [dosya listesi]
mips64el 2.3.0-15+b3 650,1 kB3.144,0 kB [dosya listesi]
ppc64el 2.3.0-15+b3 734,9 kB2.955,0 kB [dosya listesi]