Balík: sibelia (3.0.7+dfsg-3)

Odkazy pre sibelia

Zdroje Debian:

Stiahnuť zdrojový balík sibelia:

Správcovia:

Externé zdroje:

Domovská stránka [bioinf.spbau.ru]

Podobné balíky:

comparative genomics tool

Sibelia (Synteny Block ExpLoration tool) is a comparative genomics tool: It assists biologists in analysing the genomic variations that correlate with pathogens, or the genomic changes that help microorganisms adapt in different environments. Sibelia will also be helpful for the evolutionary and genome rearrangement studies for multiple strains of microorganisms.

Sibelia is useful in finding:

 1) shared regions,
 2) regions that present in one group of genomes but not in others,
 3) rearrangements that transform one genome to other genomes.

Ostatné balíky súvisiace s balíkom sibelia

závisí

odporúča

navrhuje

vylepšuje

dep: lagan

highly parametrizable pairwise global genome sequence aligner
dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

knižnica GNU C - zdieľané knižnice
tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

dep: libc6 (>= 2.4) [nie amd64, arm64, ppc64el]
dep: libdivsufsort3 (>= 2.0.1)

fast suffix array construction
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nie armel, armhf]

podporná knižnica GCC

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
dep: libstdc++6 (>= 9)

štandardná knižnica C++ GNU v3
dep: python3

interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

sug: sibelia-examples

comparative genomics tool (example data)

Stiahnuť sibelia

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry
Architektúra	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
amd64	309.7 kB	1,176.0 kB	[zoznam súborov]
arm64	278.3 kB	1,120.0 kB	[zoznam súborov]
armel	283.4 kB	1,139.0 kB	[zoznam súborov]
armhf	289.5 kB	955.0 kB	[zoznam súborov]
i386	312.3 kB	1,151.0 kB	[zoznam súborov]
mips64el	278.1 kB	1,250.0 kB	[zoznam súborov]
mipsel	276.8 kB	1,261.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64el	305.1 kB	1,228.0 kB	[zoznam súborov]
s390x	275.7 kB	1,128.0 kB	[zoznam súborov]