Pakiet: sibelia (3.0.7+dfsg-3)

Odnośniki dla sibelia

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego sibelia:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Strona internetowa [bioinf.spbau.ru]

Podobne pakiety:

comparative genomics tool

Sibelia (Synteny Block ExpLoration tool) is a comparative genomics tool: It assists biologists in analysing the genomic variations that correlate with pathogens, or the genomic changes that help microorganisms adapt in different environments. Sibelia will also be helpful for the evolutionary and genome rearrangement studies for multiple strains of microorganisms.

Sibelia is useful in finding:

 1) shared regions,
 2) regions that present in one group of genomes but not in others,
 3) rearrangements that transform one genome to other genomes.

Inne pakiety związane z sibelia

wymaga

poleca

sugeruje

enhances

dep: lagan

highly parametrizable pairwise global genome sequence aligner
dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

dep: libc6 (>= 2.4) [nie amd64, arm64, ppc64el]
dep: libdivsufsort3 (>= 2.0.1)

fast suffix array construction
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nie armel, armhf]

Biblioteka wspomagająca GCC

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
dep: libstdc++6 (>= 9)

Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3
dep: python3

interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

sug: sibelia-examples

comparative genomics tool (example data)

Pobieranie sibelia

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	309,7 KiB	1 176,0 KiB	[lista plików]
arm64	278,3 KiB	1 120,0 KiB	[lista plików]
armel	283,4 KiB	1 139,0 KiB	[lista plików]
armhf	289,5 KiB	955,0 KiB	[lista plików]
i386	312,3 KiB	1 151,0 KiB	[lista plików]
mips64el	278,1 KiB	1 250,0 KiB	[lista plików]
mipsel	276,8 KiB	1 261,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	305,1 KiB	1 228,0 KiB	[lista plików]
s390x	275,7 KiB	1 128,0 KiB	[lista plików]