Paketti: sibelia (3.0.7+dfsg-3)

Links for sibelia

Debian-palvelut:

Imuroi lähdekoodipaketti sibelia:

Ylläpitäjät:

External Resources:

Kotisivu [bioinf.spbau.ru]

Samankaltaisia paketteja:

comparative genomics tool

Sibelia (Synteny Block ExpLoration tool) is a comparative genomics tool: It assists biologists in analysing the genomic variations that correlate with pathogens, or the genomic changes that help microorganisms adapt in different environments. Sibelia will also be helpful for the evolutionary and genome rearrangement studies for multiple strains of microorganisms.

Sibelia is useful in finding:

 1) shared regions,
 2) regions that present in one group of genomes but not in others,
 3) rearrangements that transform one genome to other genomes.

Muut pakettiin sibelia liittyvät paketit

depends

recommends

suggests

enhances

dep: lagan

highly parametrizable pairwise global genome sequence aligner
dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

dep: libc6 (>= 2.4) [ei amd64, arm64, ppc64el]
dep: libdivsufsort3 (>= 2.0.1)

fast suffix array construction
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [ei armel, armhf]

GCC:n apukirjasto

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
dep: libstdc++6 (>= 9)

GNU standardi C++ -kirjasto, versio 3
dep: python3

interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

sug: sibelia-examples

comparative genomics tool (example data)

Imuroi sibelia

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille
Arkkitehtuuri	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
amd64	309.7 kt	1,176.0 kt	[tiedostoluettelo]
arm64	278.3 kt	1,120.0 kt	[tiedostoluettelo]
armel	283.4 kt	1,139.0 kt	[tiedostoluettelo]
armhf	289.5 kt	955.0 kt	[tiedostoluettelo]
i386	312.3 kt	1,151.0 kt	[tiedostoluettelo]
mips64el	278.1 kt	1,250.0 kt	[tiedostoluettelo]
mipsel	276.8 kt	1,261.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64el	305.1 kt	1,228.0 kt	[tiedostoluettelo]
s390x	275.7 kt	1,128.0 kt	[tiedostoluettelo]