všetky možnosti
buster  ] [  bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Zdroj: pirs  ]

Balík: pirs (2.0.2+dfsg-9)

Odkazy pre pirs

Screenshot

Zdroje Debian:

Stiahnuť zdrojový balík pirs:

Správcovia:

Externé zdroje:

Podobné balíky:

Profile based Illumina pair-end Reads Simulator

The program pIRS can be used for simulating Illumina PE reads, with a series of characters generated by Illumina sequencing platform, such as insert size distribution, sequencing error(substitution, insertion, deletion), quality score and GC content-coverage bias.

The insert size follows a normal distribution, so users should set the mean value and standard deviation. Usually the standard deviation is set as 1/20 of the mean value. The normal distribution by Box-Muller method is simulated.

The program simulates sequencing error, quality score and GC content- coverage bias according to the empirical distribution profile. Some default profiles counted from lots of real sequencing data are provided.

To simulate reads from diploid genome, users should simulate the diploid genome sequence firstly by setting the ratio of heterozygosis SNP, heterozygosis InDel and structure variation.

Ostatné balíky súvisiace s balíkom pirs

  • závisí
  • odporúča
  • navrhuje
  • vylepšuje

Stiahnuť pirs

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry
Architektúra Veľkosť balíka Nainštalovaná veľkosť Súbory
amd64 113.3 kB392.0 kB [zoznam súborov]
arm64 105.1 kB364.0 kB [zoznam súborov]
armel 101.5 kB350.0 kB [zoznam súborov]
armhf 101.4 kB302.0 kB [zoznam súborov]
i386 121.7 kB402.0 kB [zoznam súborov]
mips64el 114.1 kB427.0 kB [zoznam súborov]
mipsel 116.6 kB412.0 kB [zoznam súborov]
ppc64el 115.1 kB420.0 kB [zoznam súborov]
s390x 106.1 kB384.0 kB [zoznam súborov]