Balík: libvcflib-tools (1.0.2+dfsg-2)

Odkazy pre libvcflib-tools

Zdroje Debian:

Stiahnuť zdrojový balík libvcflib:

Správcovia:

Externé zdroje:

Domovská stránka [github.com]

Podobné balíky:

C++ library for parsing and manipulating VCF files (tools)

The Variant Call Format (VCF) is a flat-file, tab-delimited textual format intended to concisely describe reference-indexed variations between individuals. VCF provides a common interchange format for the description of variation in individuals and populations of samples, and has become the defacto standard reporting format for a wide array of genomic variant detectors.

vcflib provides methods to manipulate and interpret sequence variation as it can be described by VCF. It is both:

 * an API for parsing and operating on records of genomic variation as it can
   be described by the VCF format,
 * and a collection of command-line utilities for executing complex
   manipulations on VCF files.

This package contains several tools using the library.

Ostatné balíky súvisiace s balíkom libvcflib-tools

závisí

odporúča

navrhuje

vylepšuje

dep: libc6 (>= 2.29)

knižnica GNU C - zdieľané knižnice
tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb
dep: libdisorder0 (>= 0.0.2)

library for entropy measurement of byte streams
dep: libfastahack0 (>= 0.0+git20160702.bbc645f+dfsg-5~) [amd64, arm64, mips64el, ppc64el]

library for indexing and sequence extraction from FASTA files (lib)

dep: libfastahack0 (>= 1.0.0+dfsg) [nie amd64, arm64, mips64el, ppc64el]
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nie armel, armhf, ppc64el]

podporná knižnica GCC

dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4) [ppc64el]

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
dep: libsmithwaterman0 (>= 0.0+git20160702.2610e25)

determine similar regions between two strings or genomic sequences (lib)
dep: libstdc++6 (>= 5.2) [armel, armhf]

štandardná knižnica C++ GNU v3

dep: libstdc++6 (>= 9) [nie armel, armhf]
dep: libtabixpp0 (>= 1.0.0)

C++ wrapper to tabix indexer
dep: libvcflib1 (>= 1.0.2+dfsg)

C++ library for parsing and manipulating VCF files
dep: python3

interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
dep: r-base-core

jadro GNU R na štatistické výpočty a grafický systém
dep: r-cran-ggplot2

implementácia Gramatiky grafiky
dep: r-cran-gridbase

GNU R Integration of base and grid graphics
dep: r-cran-plyr

nástroje na rozdeľovanie, aplikovanie a kombinovanie dát

sug: r-cran-pracma

practical numerical math functions for GNU R

Stiahnuť libvcflib-tools

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry
Architektúra	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
amd64	703.5 kB	4,707.0 kB	[zoznam súborov]
arm64	641.8 kB	4,099.0 kB	[zoznam súborov]
armel	604.0 kB	3,654.0 kB	[zoznam súborov]
armhf	624.0 kB	2,950.0 kB	[zoznam súborov]
i386	741.8 kB	4,758.0 kB	[zoznam súborov]
mips64el	633.4 kB	4,721.0 kB	[zoznam súborov]
mipsel	639.3 kB	4,453.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64el	703.5 kB	7,435.0 kB	[zoznam súborov]
s390x	647.7 kB	4,471.0 kB	[zoznam súborov]