Paquet : libvcflib-tools (1.0.2+dfsg-2)

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Responsables :

Ressources externes :

Page d'accueil [github.com]

Paquets similaires :

C++ library for parsing and manipulating VCF files (tools)

The Variant Call Format (VCF) is a flat-file, tab-delimited textual format intended to concisely describe reference-indexed variations between individuals. VCF provides a common interchange format for the description of variation in individuals and populations of samples, and has become the defacto standard reporting format for a wide array of genomic variant detectors.

vcflib provides methods to manipulate and interpret sequence variation as it can be described by VCF. It is both:

 * an API for parsing and operating on records of genomic variation as it can
   be described by the VCF format,
 * and a collection of command-line utilities for executing complex
   manipulations on VCF files.

This package contains several tools using the library.

Autres paquets associés à libvcflib-tools

dépendances

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enhances

dep: libc6 (>= 2.29)

bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb
dep: libdisorder0 (>= 0.0.2)

library for entropy measurement of byte streams
dep: libfastahack0 (>= 0.0+git20160702.bbc645f+dfsg-5~) [amd64, arm64, mips64el, ppc64el]

library for indexing and sequence extraction from FASTA files (lib)

dep: libfastahack0 (>= 1.0.0+dfsg) [non amd64, arm64, mips64el, ppc64el]
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [non armel, armhf, ppc64el]

bibliothèque de prise en charge de GCC

dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4) [ppc64el]

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
dep: libsmithwaterman0 (>= 0.0+git20160702.2610e25)

determine similar regions between two strings or genomic sequences (lib)
dep: libstdc++6 (>= 5.2) [armel, armhf]

bibliothèque standard C++ de GNU v3

dep: libstdc++6 (>= 9) [non armel, armhf]
dep: libtabixpp0 (>= 1.0.0)

C++ wrapper to tabix indexer
dep: libvcflib1 (>= 1.0.2+dfsg)

C++ library for parsing and manipulating VCF files
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dep: r-cran-ggplot2

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dep: r-cran-gridbase

GNU R Integration of base and grid graphics
dep: r-cran-plyr

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sug: r-cran-pracma

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Télécharger libvcflib-tools

Télécharger pour toutes les architectures proposées
Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	703,5 ko	4 707,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	641,8 ko	4 099,0 ko	[liste des fichiers]
armel	604,0 ko	3 654,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	624,0 ko	2 950,0 ko	[liste des fichiers]
i386	741,8 ko	4 758,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	633,4 ko	4 721,0 ko	[liste des fichiers]
mipsel	639,3 ko	4 453,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	703,5 ko	7 435,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	647,7 ko	4 471,0 ko	[liste des fichiers]