Balík: tiddit (2.12.0+dfsg-3 a iné)

Odkazy pre tiddit

Zdroje Debian:

Stiahnuť zdrojový balík tiddit:

Správcovia:

Externé zdroje:

Domovská stránka [github.com]

Podobné balíky:

structural variant calling

TIDDIT is a tool to used to identify chromosomal rearrangements using Mate Pair or Paired End sequencing data. TIDDIT identifies intra and inter- chromosomal translocations, deletions, tandem-duplications and inversions, using supplementary alignments as well as discordant pairs.

TIDDIT has two analysis modules. The sv mode, which is used to search for structural variants. And the cov mode that analyse the read depth of a bam file and generates a coverage report.

Ostatné balíky súvisiace s balíkom tiddit

závisí

odporúča

navrhuje

vylepšuje

dep: libbamtools2.5.1 (>= 2.5.1+dfsg)

dynamic library for manipulating BAM (genome alignment) files
dep: libc6 (>= 2.4)

knižnica GNU C - zdieľané knižnice
tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 4.2)

podporná knižnica GCC
dep: libstdc++6 (>= 9)

štandardná knižnica C++ GNU v3
dep: python3

interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

dep: python3 (<< 3.10)

dep: python3 (>= 3.9~)

Stiahnuť tiddit

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry
Architektúra	Verzia	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
i386	2.12.0+dfsg-3+b1	239.5 kB	1,019.0 kB	[zoznam súborov]