Пакет: seaview (1:4.7-1)

Ссылки для seaview

Ресурсы Debian:

Исходный код seaview:

Сопровождающие:

Внешние ресурсы:

Сайт [doua.prabi.fr]

Подобные пакеты:

Multiplatform interface for sequence alignment and phylogeny

SeaView reads and writes various file formats (NEXUS, MSF, CLUSTAL, FASTA, PHYLIP, MASE, Newick) of DNA and protein sequences and of phylogenetic trees. Alignments can be manually edited. It drives the programs Muscle or Clustal Omega for multiple sequence alignment, and also allows one to use any external alignment algorithm able to read and write FASTA-formatted files. It computes phylogenetic trees by parsimony using PHYLIP's dnapars/protpars algorithm, by distance with NJ or BioNJ algorithms on a variety of evolutionary distances, or by maximum likelihood using the program PhyML 3.0. SeaView draws phylogenetic trees on screen or PostScript files, and allows one to download sequences from EMBL/GenBank/UniProt using the Internet.

Теги: Область: Биология, Биоинформатика, Реализовано на: implemented-in::c, implemented-in::c++, Пользовательский интерфейс: Командная строка, interface::graphical, interface::x11, Сеть: Клиент, Сетевой протокол: Требуется дополнительный тег, Роль: role::program, scope::utility, Инструментарий интерфейса: FLTK, Цель: Требуется дополнительный тег, use::comparing, use::editing, Печать, use::viewing, works-with-format::plaintext, Работает с: works-with::biological-sequence, x11::application

Другие пакеты, относящиеся к seaview

зависимости

рекомендации

предложения

enhances

dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.17) [arm64]

dep: libc6 (>= 2.7) [armhf, i386]
dep: libfltk-images1.3

Fast Light Toolkit - image loading support
dep: libfltk1.3 (>= 1.3.4)

Fast Light Toolkit - main shared library
dep: libgcc1 (>= 1:3.0) [не armhf]

вспомогательная библиотека GCC

dep: libgcc1 (>= 1:3.5) [armhf]
dep: libstdc++6 (>= 5)

стандартная библиотека GNU C++ версии 3
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

библиотека сжатия

rec: clustalo

General purpose multiple sequence alignment program for proteins
rec: muscle

Multiple alignment program of protein sequences
rec: phyml

Phylogenetic estimation using Maximum Likelihood

Загрузка seaview

Загрузить для всех доступных архитектур
Архитектура	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
amd64	340,5 Кб	849,0 Кб	[список файлов]
arm64	313,1 Кб	821,0 Кб	[список файлов]
armhf	289,8 Кб	579,0 Кб	[список файлов]
i386	357,7 Кб	899,0 Кб	[список файлов]