[ Источник: sprai ]
Пакет: sprai (0.9.9.23+dfsg-2)
Ссылки для sprai
Ресурсы Debian:
- Сообщения об ошибках
- Developer Information
- Debian журнал изменений
- Файл авторских прав
- Отслеживание заплат Debian
Исходный код sprai:
Сопровождающие:
Внешние ресурсы:
- Сайт [zombie.cb.k.u-tokyo.ac.jp]
Подобные пакеты:
single-pass sequencing read accuracy improver
Sprai is a tool to correct sequencing errors in single-pass reads for de novo assembly. It is originally designed for correcting sequencing errors in single-molecule DNA sequencing reads, especially in Continuous Long Reads (CLRs) generated by PacBio RS sequencers. The goal of Sprai is not maximizing the accuracy of error-corrected reads. Instead, Sprai aims at maximizing the continuity (i.e., N50 contig length) of assembled contigs after error correction.
Другие пакеты, относящиеся к sprai
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.17) [arm64]
- библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.7) [не arm64]
-
- dep: ncbi-blast+ (>= 2.2.27)
- поиск первичных биологических последовательностей
-
- dep: perl
- практический язык Ларри Уолла для извлечения данных и составления отчётов
-
- dep: time
- GNU time — программа для измерения использования ресурсов
-
- sug: make
- утилита управления компиляцией
-
- sug: pbalign
- map Pacific Biosciences reads to reference DNA sequences
-
- sug: pbgenomicconsensus
- Pacific Biosciences variant and consensus caller
-
- sug: pbh5tools
- tools for manipulating Pacific Biosciences HDF5 files
Загрузка sprai
| Архитектура | Размер пакета | В установленном виде | Файлы |
|---|---|---|---|
| amd64 | 1 480,4 Кб | 1 715,0 Кб | [список файлов] |
| arm64 | 1 477,5 Кб | 1 699,0 Кб | [список файлов] |
| armhf | 1 474,3 Кб | 1 667,0 Кб | [список файлов] |
| i386 | 1 480,1 Кб | 1 715,0 Кб | [список файлов] |