Balík: sprai (0.9.9.23+dfsg-2)

Odkazy pre sprai

Zdroje Debian:

Stiahnuť zdrojový balík sprai:

Správcovia:

Externé zdroje:

Domovská stránka [zombie.cb.k.u-tokyo.ac.jp]

Podobné balíky:

single-pass sequencing read accuracy improver

Sprai is a tool to correct sequencing errors in single-pass reads for de novo assembly. It is originally designed for correcting sequencing errors in single-molecule DNA sequencing reads, especially in Continuous Long Reads (CLRs) generated by PacBio RS sequencers. The goal of Sprai is not maximizing the accuracy of error-corrected reads. Instead, Sprai aims at maximizing the continuity (i.e., N50 contig length) of assembled contigs after error correction.

Ostatné balíky súvisiace s balíkom sprai

závisí

odporúča

navrhuje

vylepšuje

dep: libc6 (>= 2.17) [arm64]

knižnica GNU C - zdieľané knižnice
tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.7) [nie arm64]
dep: ncbi-blast+ (>= 2.2.27)

next generation suite of BLAST sequence search tools
dep: perl

Practical Extraction and Report Language od Larryho Walla
dep: time

program GNU time na meranie využitia zdrojov CPU

sug: make

nástroj na riadenie kompilácie
sug: pbalign

map Pacific Biosciences reads to reference DNA sequences
sug: pbgenomicconsensus

Pacific Biosciences variant and consensus caller
sug: pbh5tools

tools for manipulating Pacific Biosciences HDF5 files

Stiahnuť sprai

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry
Architektúra	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
amd64	1,480.4 kB	1,715.0 kB	[zoznam súborov]
arm64	1,477.5 kB	1,699.0 kB	[zoznam súborov]
armhf	1,474.3 kB	1,667.0 kB	[zoznam súborov]
i386	1,480.1 kB	1,715.0 kB	[zoznam súborov]