[ ソース: sprai ]
パッケージ: sprai (0.9.9.23+dfsg-2)
sprai に関するリンク
Debian の資源:
sprai ソースパッケージをダウンロード:
メンテナ:
外部の資源:
- ホームページ [zombie.cb.k.u-tokyo.ac.jp]
類似のパッケージ:
single-pass sequencing read accuracy improver
Sprai is a tool to correct sequencing errors in single-pass reads for de novo assembly. It is originally designed for correcting sequencing errors in single-molecule DNA sequencing reads, especially in Continuous Long Reads (CLRs) generated by PacBio RS sequencers. The goal of Sprai is not maximizing the accuracy of error-corrected reads. Instead, Sprai aims at maximizing the continuity (i.e., N50 contig length) of assembled contigs after error correction.
その他の sprai 関連パッケージ
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- dep: libc6 (>= 2.17) [arm64]
- GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.7) [arm64 以外]
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- dep: ncbi-blast+ (>= 2.2.27)
- next generation suite of BLAST sequence search tools
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- dep: perl
- Larry Wall 作の実用的な抽出とレポート用の言語
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- dep: time
- GNU time - CPU リソース使用率計測プログラム
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- sug: make
- コンパイルを制御するユーティリティ
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- sug: pbalign
- map Pacific Biosciences reads to reference DNA sequences
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- sug: pbgenomicconsensus
- Pacific Biosciences variant and consensus caller
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- sug: pbh5tools
- tools for manipulating Pacific Biosciences HDF5 files