все параметры
bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Источник: lighter  ]

Пакет: lighter (1.1.2-5)

Ссылки для lighter

Screenshot

Ресурсы Debian:

Исходный код lighter:

Сопровождающие:

Внешние ресурсы:

Подобные пакеты:

fast and memory-efficient sequencing error corrector

Lighter is a fast, memory-efficient tool for correcting sequencing errors. Lighter avoids counting k-mers. Instead, it uses a pair of Bloom filters, one holding a sample of the input k-mers and the other holding k-mers likely to be correct. As long as the sampling fraction is adjusted in inverse proportion to the depth of sequencing, Bloom filter size can be held constant while maintaining near-constant accuracy. Lighter is parallelized, uses no secondary storage, and is both faster and more memory-efficient than competing approaches while achieving comparable accuracy.

Другие пакеты, относящиеся к lighter

  • зависимости
  • рекомендации
  • предложения
  • enhances

Загрузка lighter

Загрузить для всех доступных архитектур
Архитектура Размер пакета В установленном виде Файлы
amd64 45,6 Кб124,0 Кб [список файлов]
arm64 43,9 Кб116,0 Кб [список файлов]
armel 43,7 Кб119,0 Кб [список файлов]
armhf 43,8 Кб103,0 Кб [список файлов]
i386 50,5 Кб131,0 Кб [список файлов]
mips64el 48,6 Кб131,0 Кб [список файлов]
mipsel 52,4 Кб137,0 Кб [список файлов]
ppc64el 48,9 Кб180,0 Кб [список файлов]
s390x 45,4 Кб128,0 Кб [список файлов]