パッケージ: lighter (1.1.2-5)

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類似のパッケージ:

fast and memory-efficient sequencing error corrector

Lighter is a fast, memory-efficient tool for correcting sequencing errors. Lighter avoids counting k-mers. Instead, it uses a pair of Bloom filters, one holding a sample of the input k-mers and the other holding k-mers likely to be correct. As long as the sampling fraction is adjusted in inverse proportion to the depth of sequencing, Bloom filter size can be held constant while maintaining near-constant accuracy. Lighter is parallelized, uses no secondary storage, and is both faster and more memory-efficient than competing approaches while achieving comparable accuracy.

その他の lighter 関連パッケージ

依存

推奨

提案

enhances

dep: libc6 (>= 2.29)

GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [armel, armhf, i386, mipsel 以外]

GCC 共有ライブラリ

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, mipsel]
dep: libstdc++6 (>= 5)

GNU 標準 C++ ライブラリ v3
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

圧縮ライブラリ - ランタイム

lighter のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード
アーキテクチャ	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
amd64	45.6 kB	124.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	43.9 kB	116.0 kB	[ファイル一覧]
armel	43.7 kB	119.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	43.8 kB	103.0 kB	[ファイル一覧]
i386	50.5 kB	131.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	48.6 kB	131.0 kB	[ファイル一覧]
mipsel	52.4 kB	137.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	48.9 kB	180.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	45.4 kB	128.0 kB	[ファイル一覧]