Pakiet: libtfbs-perl (0.7.1+ds-4 i inne)

Odnośniki dla libtfbs-perl

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego libtfbs-perl:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Strona internetowa [tfbs.genereg.net]

Podobne pakiety:

scanning DNA sequence with a position weight matrix

The TFBS perl modules comprise a set of routines to interact with the Transfac and Jaspar databases that describe a special family of proteins, the transcription factors. These bind to genomic DNA to initiate (or prevent) the readout of a gene. Once multiple binding sites are known for a transcription factor, these are gathered in a single file and are aligned in order to find position-specific characteristica that might be used to predict such binding events in novel DNA sequences.

If you use TFBS in your work, please cite "Lenhard B., Wasserman W.W. (2002) TFBS: Computational framework for transcription factor binding site analysis. Bioinformatics 18:1135-1136".

Note: the TFBS perl module is no longer under active development. All the functionality can be found in the TFBSTools Bioconductor package; users are highly encouraged to switch. <http://bioconductor.org/packages/TFBSTools/>

Znaczniki: Rozwój oprogramowania: Rozwijanie w języku Perl, Biblioteki, Dziedzina: field::biology, field::biology:bioinformatics, Zaimplementowane w: C, implemented-in::perl, interface::commandline, Rola: Biblioteka deweloperska, Program

Inne pakiety związane z libtfbs-perl

wymaga

poleca

sugeruje

enhances

dep: bioperl

Narzędzia do obliczeniowej biologii molekularnej, oparte na Perlu
dep: libc6 (>= 2.38) [nie alpha, ia64, sh4]

Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.40) [sh4]
dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.38) [alpha]
dep: libdbi-perl

Interfejs bazodanowy Perl (DBI)
dep: libwww-perl

Prosty i spójny interfejs do WWW
dep: pdl (>= 1:2.085-1) [ia64]

perl data language: Perl extensions for numerics

dep: pdl (>= 1:2.093-1+b1) [nie alpha, hppa, ia64]

dep: pdl (>= 1:2.095-1) [hppa]

dep: pdl (>= 1:2.098-3) [alpha]
dep: pdlapi-20

pakiet wirtualny udostępniany przez pdl
dep: perl (>= 5.38.2-3.2) [ia64]

praktyczny język ekstrakcji i raportowania Larry'ego Walla

dep: perl (>= 5.40.0-6) [nie alpha, hppa, ia64]

dep: perl (>= 5.40.0-8) [alpha, hppa]
dep: perlapi-5.38.2 [ia64]

pakiet wirtualny udostępniany przez perl-base
dep: perlapi-5.40.0 [nie ia64]

pakiet wirtualny udostępniany przez perl-base

rec: libgd-gd2-perl

pakiet wirtualny udostępniany przez libgd-perl

lub libgd-gd2-noxpm-perl

pakiet wirtualny udostępniany przez libgd-perl

Pobieranie libtfbs-perl

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
alpha (port nieoficjalny)	0.7.1+ds-4	218,0 KiB	1 029,0 KiB	[lista plików]
amd64	0.7.1+ds-4+b1	216,4 KiB	981,0 KiB	[lista plików]
arm64	0.7.1+ds-4+b1	216,7 KiB	1 029,0 KiB	[lista plików]
armel	0.7.1+ds-4+b1	217,6 KiB	981,0 KiB	[lista plików]
armhf	0.7.1+ds-4+b1	215,8 KiB	977,0 KiB	[lista plików]
hppa (port nieoficjalny)	0.7.1+ds-4+b1	217,9 KiB	982,0 KiB	[lista plików]
i386	0.7.1+ds-4+b1	217,0 KiB	981,0 KiB	[lista plików]
ia64 (port nieoficjalny)	0.7.1+ds-3	218,4 KiB	985,0 KiB	[lista plików]
m68k (port nieoficjalny)	0.7.1+ds-4+b1	215,6 KiB	981,0 KiB	[lista plików]
mips64el	0.7.1+ds-4+b1	216,5 KiB	1 030,0 KiB	[lista plików]
ppc64 (port nieoficjalny)	0.7.1+ds-4+b1	217,6 KiB	1 029,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	0.7.1+ds-4+b1	217,3 KiB	1 029,0 KiB	[lista plików]
riscv64	0.7.1+ds-4+b1	216,6 KiB	977,0 KiB	[lista plików]
s390x	0.7.1+ds-4+b1	216,5 KiB	981,0 KiB	[lista plików]
sh4 (port nieoficjalny)	0.7.1+ds-4+b1	219,2 KiB	1 029,0 KiB	[lista plików]
sparc64 (port nieoficjalny)	0.7.1+ds-4+b1	216,4 KiB	1 991,0 KiB	[lista plików]
x32 (port nieoficjalny)	0.7.1+ds-4+b1	216,4 KiB	981,0 KiB	[lista plików]