Pakiet: examl (3.0.22-5)

Odnośniki dla examl

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego examl:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Strona internetowa [github.com]

Podobne pakiety:

Exascale Maximum Likelihood (ExaML) code for phylogenetic inference

Exascale Maximum Likelihood (ExaML) is a code for phylogenetic inference using MPI. This code implements the popular RAxML search algorithm for maximum likelihood based inference of phylogenetic trees.

ExaML is a strapped-down light-weight version of RAxML for phylogenetic inference on huge datasets. It can only execute some very basic functions and is intended for computer-savvy users that can write little perl-scripts and have experience using queue submission scripts for clusters. ExaML only implements the CAT and GAMMA models of rate heterogeneity for binary, DNA, and protein data.

ExaML uses a radically new MPI parallelization approach that yields improved parallel efficiency, in particular on partitioned multi-gene or whole-genome datasets. It also implements a new load balancing algorithm that yields better parallel efficiency.

It is up to 4 times faster than its predecessor RAxML-Light and scales to a larger number of processors.

Inne pakiety związane z examl

wymaga

poleca

sugeruje

enhances

dep: libc6 (>= 2.34) [nie alpha, ia64, sh4, x32]

Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

dep: libc6 (>= 2.38) [x32]
dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
dep: libgomp1 (>= 4.2.1) [sparc64]

Biblioteka wspierająca GCC OpenMP (GOMP)
dep: libopenmpi3t64 (>= 4.1.6)

high performance message passing library -- shared library
dep: openmpi-bin

high performance message passing library -- binaries

Pobieranie examl

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
alpha (port nieoficjalny)	834,3 KiB	1 919,0 KiB	[lista plików]
amd64	931,6 KiB	5 969,0 KiB	[lista plików]
arm64	780,5 KiB	1 663,0 KiB	[lista plików]
armel	796,9 KiB	1 872,0 KiB	[lista plików]
armhf	785,1 KiB	1 520,0 KiB	[lista plików]
hppa (port nieoficjalny)	813,5 KiB	1 750,0 KiB	[lista plików]
i386	1 078,8 KiB	7 035,0 KiB	[lista plików]
ia64 (port nieoficjalny)	955,5 KiB	2 818,0 KiB	[lista plików]
m68k (port nieoficjalny)	763,5 KiB	1 780,0 KiB	[lista plików]
mips64el	816,6 KiB	1 811,0 KiB	[lista plików]
ppc64 (port nieoficjalny)	836,8 KiB	1 919,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	845,9 KiB	1 919,0 KiB	[lista plików]
riscv64	840,2 KiB	1 591,0 KiB	[lista plików]
s390x	818,0 KiB	1 995,0 KiB	[lista plików]
sh4 (port nieoficjalny)	889,8 KiB	1 852,0 KiB	[lista plików]
sparc64 (port nieoficjalny)	826,9 KiB	3 716,0 KiB	[lista plików]
x32 (port nieoficjalny)	782,7 KiB	1 744,0 KiB	[lista plików]