Pakiet: khmer (2.1.2+dfsg-6)

Odnośniki dla khmer

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego khmer:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Strona internetowa [khmer.readthedocs.org]

Podobne pakiety:

Zliczanie k-merów sekwencji DNA w pamięci, filtrowanie i przeglądanie wykresów

khmer to biblioteka i zestaw narzędzi wiersza poleceń do pracy z sekwencją DNA. Jest skierowany przede wszystkim do krótkich odczytów danych sekwencjonowania, takich jak te wytwarzane przez platformę Illumina. khmer przyjmuje podejście skoncentrowane na k-merach do analizy sekwencji, i stąd wywodzi się jego nazwa.

Znaczniki: Biologia: Fasta/Pearson, Kwasy nukleinowe, Dziedzina: field::biology, field::biology:bioinformatics, Zaimplementowane w: implemented-in::c++, implemented-in::python, Interfejs użytkownika: Wiersz poleceń, Rola: role::program, use::analysing, Przeznaczenie: Porównywanie, Filtrowanie

Inne pakiety związane z khmer

wymaga

poleca

sugeruje

enhances

dep: cython3 (>= 0.26.1)

C-Extensions for Python 3
dep: khmer-common

common files for the khmer project tools
dep: libbz2-1.0

Wysokiej jakości biblioteka kompresji plików - wersja uruchomieniowa
dep: libc6 (>= 2.14)

Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb
dep: libgcc1 (>= 1:3.4)

Biblioteka wspomagająca GCC
dep: libgomp1 (>= 4.9)

Biblioteka wspierająca GCC OpenMP (GOMP)
dep: libstdc++6 (>= 5.2)

Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3
dep: python3

Interaktywny, wysokopoziomowy i obiektowy język programowania (domyślna wersja Python 3)

dep: python3 (<< 3.8)

dep: python3 (>= 3.7~)
dep: python3-bz2file

Python3 library for reading and writing bzip2-compressed files
dep: python3-screed (>= 1.0)

short nucleotide read sequence utils in Python 3
dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.4)

Biblioteka kompresyjna - pliki wykonawcze

Pobieranie khmer

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	6 488,5 KiB	29 563,0 KiB	[lista plików]