Balík: khmer (2.1.2+dfsg-6)

Odkazy pre khmer

Zdroje Debian:

Stiahnuť zdrojový balík khmer:

Správcovia:

Externé zdroje:

Domovská stránka [khmer.readthedocs.org]

Podobné balíky:

in-memory DNA sequence kmer counting, filtering & graph traversal

khmer is a library and suite of command line tools for working with DNA sequence. It is primarily aimed at short-read sequencing data such as that produced by the Illumina platform. khmer takes a k-mer-centric approach to sequence analysis, hence the name.

Značky: Biológia: Fasta/Pearson, Nucleic Acids, Pole: field::biology, field::biology:bioinformatics, Implementované v: implemented-in::c++, implemented-in::python, User Interface: Príkazový riadok, Role: role::program, use::analysing, Purpose: Porovnávanie, Filtrovanie

Ostatné balíky súvisiace s balíkom khmer

závisí

odporúča

navrhuje

vylepšuje

dep: cython3 (>= 0.26.1)

rozšírenia v jazyku C pre Python 3
dep: khmer-common

common files for the khmer project tools
dep: libbz2-1.0

kvalitná knižnica na komprimáciu súborov s triedením blokov - dynamická knižnica
dep: libc6 (>= 2.14)

knižnica GNU C - zdieľané knižnice
tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb
dep: libgcc1 (>= 1:3.4)

podporná knižnica GCC
dep: libgomp1 (>= 4.9)

podporná knižnica GCC OpenMP (GOMP)
dep: libstdc++6 (>= 5.2)

štandardná knižnica C++ GNU v3
dep: python3

interaktívny vysokoúrovňový objektovo orientovaný jazyk (predvolená verzia python3)

dep: python3 (<< 3.8)

dep: python3 (>= 3.7~)
dep: python3-bz2file

Python3 library for reading and writing bzip2-compressed files
dep: python3-screed (>= 1.0)

short nucleotide read sequence utils in Python 3
dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.4)

komprimačná knižnica - dynamická verzia

Stiahnuť khmer

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry
Architektúra	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
amd64	6,488.5 kB	29,563.0 kB	[zoznam súborov]