Pakiet: tiddit (2.12.0+dfsg-3 i inne)

Odnośniki dla tiddit

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego tiddit:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Strona internetowa [github.com]

Podobne pakiety:

structural variant calling

TIDDIT is a tool to used to identify chromosomal rearrangements using Mate Pair or Paired End sequencing data. TIDDIT identifies intra and inter- chromosomal translocations, deletions, tandem-duplications and inversions, using supplementary alignments as well as discordant pairs.

TIDDIT has two analysis modules. The sv mode, which is used to search for structural variants. And the cov mode that analyse the read depth of a bam file and generates a coverage report.

Inne pakiety związane z tiddit

wymaga

poleca

sugeruje

enhances

dep: libbamtools2.5.1 (>= 2.5.1+dfsg)

dynamic library for manipulating BAM (genome alignment) files
dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

dep: libc6 (>= 2.4) [nie amd64, arm64, ppc64el]
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nie armel, armhf, i386, mipsel]

Biblioteka wspomagająca GCC

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, mipsel]
dep: libstdc++6 (>= 5.2) [armel, armhf]

Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

dep: libstdc++6 (>= 9) [nie armel, armhf]
dep: python3

interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

dep: python3 (<< 3.10)

dep: python3 (>= 3.9~)

Pobieranie tiddit

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	2.12.0+dfsg-3+b1	245,1 KiB	1 040,0 KiB	[lista plików]
arm64	2.12.0+dfsg-3+b1	206,7 KiB	835,0 KiB	[lista plików]
armel	2.12.0+dfsg-3+b1	207,0 KiB	810,0 KiB	[lista plików]
armhf	2.12.0+dfsg-3+b1	213,0 KiB	578,0 KiB	[lista plików]
i386	2.12.0+dfsg-3+b1	239,5 KiB	1 019,0 KiB	[lista plików]
mips64el	2.12.0+dfsg-3+b1	199,4 KiB	928,0 KiB	[lista plików]
mipsel	2.12.0+dfsg-3+b1	203,4 KiB	888,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	2.12.0+dfsg-3+b1	228,0 KiB	1 168,0 KiB	[lista plików]
s390x	2.12.0+dfsg-3+b1	200,7 KiB	951,0 KiB	[lista plików]