Pakiet: minimap (0.2-5)

Odnośniki dla minimap

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego minimap:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Strona internetowa [github.com]

Podobne pakiety:

Narzędzie do przybliżonego mapowania długich biosekwencji, takich jak odczyty DNA

Minimap to eksperymentalne narzędzie umożliwiające efektywne znajdowanie wielu przybliżonych pozycji mapowania pomiędzy dwoma zestawami długich sekwencji biologicznych, np. pomiędzy odczytami DNA a genomami referencyjnymi, pomiędzy genomami oraz pomiędzy długimi, zaszumionymi odczytami. Minimap nie generuje obecnie wyrównań i z tego powodu jest zwykle dziesiątki razy szybszy niż należące do głównego nurtu narzędzia wyrównujące. Nie zastępuje powszechnie stosowanych algorytmów wyrównywania, ale może być przydatny, gdy zachodzi potrzeba szybkiej identyfikacji długich przybliżonych dopasowań przy umiarkowanej rozbieżności w ogromnym zbiorze sekwencji. W przypadku tego zadania jest on znacznie szybszy niż większość istniejących narzędzi.

Znaczniki: Dziedzina: Biologia, Bioinformatyka, Zaimplementowane w: implemented-in::c, interface::commandline, Rola: Program, Zakres: scope::utility, use::calculating, Działa z: Sekwencje biologiczne

Inne pakiety związane z minimap

wymaga

poleca

sugeruje

enhances

dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

dep: libc6 (>= 2.4) [nie amd64, arm64, ppc64el]
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

Biblioteka kompresyjna - pliki wykonawcze

Pobieranie minimap

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	26,4 KiB	67,0 KiB	[lista plików]
arm64	24,8 KiB	63,0 KiB	[lista plików]
armel	26,6 KiB	66,0 KiB	[lista plików]
armhf	24,2 KiB	50,0 KiB	[lista plików]
i386	29,1 KiB	70,0 KiB	[lista plików]
mips64el	26,6 KiB	70,0 KiB	[lista plików]
mipsel	27,4 KiB	68,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	28,3 KiB	83,0 KiB	[lista plików]
s390x	25,6 KiB	67,0 KiB	[lista plików]