wszystkie opcje
buster  ] [  bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Pakiet źródłowy: minimap  ]

Pakiet: minimap (0.2-4)

Odnośniki dla minimap

Screenshot

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego minimap:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Podobne pakiety:

Narzędzie do przybliżonego mapowania długich biosekwencji, takich jak odczyty DNA

Minimap to eksperymentalne narzędzie umożliwiające efektywne znajdowanie wielu przybliżonych pozycji mapowania pomiędzy dwoma zestawami długich sekwencji biologicznych, np. pomiędzy odczytami DNA a genomami referencyjnymi, pomiędzy genomami oraz pomiędzy długimi, zaszumionymi odczytami. Minimap nie generuje obecnie wyrównań i z tego powodu jest zwykle dziesiątki razy szybszy niż należące do głównego nurtu narzędzia wyrównujące. Nie zastępuje powszechnie stosowanych algorytmów wyrównywania, ale może być przydatny, gdy zachodzi potrzeba szybkiej identyfikacji długich przybliżonych dopasowań przy umiarkowanej rozbieżności w ogromnym zbiorze sekwencji. W przypadku tego zadania jest on znacznie szybszy niż większość istniejących narzędzi.

Znaczniki: Dziedzina: Biologia, Bioinformatyka, Zaimplementowane w: implemented-in::c, interface::commandline, Rola: Program, Zakres: scope::utility, use::calculating, Działa z: Sekwencje biologiczne

Inne pakiety związane z minimap

  • wymaga
  • poleca
  • sugeruje
  • enhances

Pobieranie minimap

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura Rozmiar pakietu Rozmiar po instalacji Pliki
amd64 26,6 KiB71,0 KiB [lista plików]
arm64 24,6 KiB63,0 KiB [lista plików]
armhf 24,1 KiB50,0 KiB [lista plików]
i386 29,3 KiB74,0 KiB [lista plików]