Package: minimap (0.2-5)

strumento per mappatura approssimata di biosequenze lunghe come letture di DNA

Minimap è uno strumento sperimentale per trovare in modo efficiente posizioni di mappatura approssimate multiple tra due insiemi di lunghe sequenze biologiche, come tra letture di DNA e genomi di riferimento, tra genomi e tra lunghe letture con rumore. Minimap attualmente non genera allineamenti e pertanto è solitamente decine di volte più veloce degli strumenti di allineamento più popolari. Non rimpiazza tali strumenti, ma può essere utile quando si desidera identificare velocemente lunghe corrispondenze approssimate con divergenze moderate in una enorme raccolta di sequenze. Per questo compito è molto più veloce della maggior parte degli strumenti esistenti.

Tags: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, Role: Program, Scope: scope::utility, use::calculating, Works with: Biological Sequence

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