Пакет: gmap (2021-12-17+ds-3)

Връзки за gmap

Ресурси за Debian:

Изтегляне на пакет-източник gmap.

Отговорници:

Външни препратки:

Начална страница [research-pub.gene.com]

Подобни пакети:

spliced and SNP-tolerant alignment for mRNA and short reads

This package contains the programs GMAP and GSNAP as well as utilities to manage genome databases in GMAP/GSNAP format. GMAP (Genomic Mapping and Alignment Program) is a tool for aligning EST, mRNA and cDNA sequences. GSNAP (Genomic Short-read Nucleotide Alignment Program) is a tool for aligning single-end and paired-end transcriptome reads. Both tools can use a database of

 * known splice sites and identify novel splice sites.
 * known single-nucleotide polymorphisms (SNPs).

GSNAP can align bisulfite-treated DNA.

Етикети: Field: Biology, field::biology:bioinformatics, field::biology:structural, Role: Program, Purpose: Analysing

Други пакети, свързани с gmap

зависимости

препоръчани

предложени

enhances

dep: libbz2-1.0

high-quality block-sorting file compressor library - runtime
dep: libc6 (>= 2.34)

GNU C Library: Shared libraries
също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb
dep: perl

Larry Wall's Practical Extraction and Report Language
dep: zlib1g (>= 1:1.2.6)

compression library - runtime

Изтегляне на gmap

Изтегляне за всички налични архитектури
Архитектура	Големина на пакета	Големина след инсталиране	Файлове
amd64	11 077,9 кБ	89 482,0 кБ	[списък на файловете]
arm64	6 950,3 кБ	58 950,0 кБ	[списък на файловете]
armel	5 407,5 кБ	44 524,0 кБ	[списък на файловете]
armhf	5 788,3 кБ	42 476,0 кБ	[списък на файловете]
i386	6 086,9 кБ	43 904,0 кБ	[списък на файловете]
mips64el	5 331,8 кБ	55 440,0 кБ	[списък на файловете]
mipsel	5 324,2 кБ	46 108,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64el	7 299,8 кБ	60 998,0 кБ	[списък на файловете]