パッケージ: zalign (0.9.1-5)

zalign に関するリンク

Debian の資源:

zalign ソースパッケージをダウンロード:

メンテナ:

外部の資源:

ホームページ [launchpad.net]

類似のパッケージ:

parallel local alignment of biological sequences

zAlign is a local sequence aligner, especially intended for use with large biological DNA sequences, with more than 1Mbp (Millions of base pairs). It uses the Smith-Waterman exact algorithm with affine gap cost function to perform this task.

zAlign can be used both in distributed (clusters, for example) or standalone environments. Currently it has been tested on Linux and Sun Solaris, using both the MPICH (http://www.mcs.anl.gov/research/projects/mpi/mpich1/) and OpenMPI (http://www.open-mpi.org/) implementations. Ports for other Unix-like environments are highly considered.

その他の zalign 関連パッケージ

依存

推奨

提案

enhances

dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

dep: libc6 (>= 2.4) [amd64, arm64, ppc64el 以外]
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [armel, armhf 以外]

GCC 共有ライブラリ

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
dep: libopenmpi3 (>= 4.0.5)

high performance message passing library -- shared library
dep: libstdc++6 (>= 4.9)

GNU 標準 C++ ライブラリ v3

zalign のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード
アーキテクチャ	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
amd64	47.9 kB	267.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	45.1 kB	263.0 kB	[ファイル一覧]
armel	25.4 kB	117.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	25.6 kB	97.0 kB	[ファイル一覧]
i386	48.4 kB	261.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	50.3 kB	550.0 kB	[ファイル一覧]
mipsel	48.9 kB	318.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	50.7 kB	415.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	46.5 kB	287.0 kB	[ファイル一覧]