Pakiet: zalign (0.9.1-5)

Odnośniki dla zalign

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego zalign:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Strona internetowa [launchpad.net]

Podobne pakiety:

parallel local alignment of biological sequences

zAlign is a local sequence aligner, especially intended for use with large biological DNA sequences, with more than 1Mbp (Millions of base pairs). It uses the Smith-Waterman exact algorithm with affine gap cost function to perform this task.

zAlign can be used both in distributed (clusters, for example) or standalone environments. Currently it has been tested on Linux and Sun Solaris, using both the MPICH (http://www.mcs.anl.gov/research/projects/mpi/mpich1/) and OpenMPI (http://www.open-mpi.org/) implementations. Ports for other Unix-like environments are highly considered.

Inne pakiety związane z zalign

wymaga

poleca

sugeruje

enhances

dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

dep: libc6 (>= 2.4) [nie amd64, arm64, ppc64el]
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nie armel, armhf]

Biblioteka wspomagająca GCC

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
dep: libopenmpi3 (>= 4.0.5)

high performance message passing library -- shared library
dep: libstdc++6 (>= 4.9)

Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

Pobieranie zalign

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	47,9 KiB	267,0 KiB	[lista plików]
arm64	45,1 KiB	263,0 KiB	[lista plików]
armel	25,4 KiB	117,0 KiB	[lista plików]
armhf	25,6 KiB	97,0 KiB	[lista plików]
i386	48,4 KiB	261,0 KiB	[lista plików]
mips64el	50,3 KiB	550,0 KiB	[lista plików]
mipsel	48,9 KiB	318,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	50,7 KiB	415,0 KiB	[lista plików]
s390x	46,5 KiB	287,0 KiB	[lista plików]