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[ Source: zalign ]
Package: zalign (0.9.1-5)
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Maintainers:
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- Homepage [launchpad.net]
Similar packages:
allineamento locale parallelo di sequenze biologiche
zAlign è un allineatore di sequenze locali, specificamente pensato per l'uso con grandi sequenze biologiche di DNA, con più di 1Mbp (milioni di paia di basi). Per svolgere questo compito usa l'algoritmo esatto di Smith-Waterman con la funzione di costo affine per i gap.
zAlign può essere usato sia in ambienti distribuiti (cluster, per esempio) sia autonomi. Al momento è stato collaudato su Linux e Sun Solaris, usando entrambe le implementazioni MPICH (http://www.mcs.anl.gov/research/projects/mpi/mpich1/) e OpenMPI (http://www.open-mpi.org/). C'è un grande interesse per i port per gli altri ambienti simil-Unix.
Other Packages Related to zalign
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- dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]
- Libreria C GNU: librerie condivise
also a virtual package provided by libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]
- dep: libc6 (>= 2.4) [not amd64, arm64, ppc64el]
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- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [not armel, armhf]
- libreria di supporto a GCC
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
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- dep: libopenmpi3 (>= 4.0.5)
- libreria per il passaggio di messaggi dalle alte prestazioni - libreria condivisa
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- dep: libstdc++6 (>= 4.9)
- libreria GNU Standard C++, versione 3
Download zalign
| Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
|---|---|---|---|
| amd64 | 47.9 kB | 267.0 kB | [list of files] |
| arm64 | 45.1 kB | 263.0 kB | [list of files] |
| armel | 25.4 kB | 117.0 kB | [list of files] |
| armhf | 25.6 kB | 97.0 kB | [list of files] |
| i386 | 48.4 kB | 261.0 kB | [list of files] |
| mips64el | 50.3 kB | 550.0 kB | [list of files] |
| mipsel | 48.9 kB | 318.0 kB | [list of files] |
| ppc64el | 50.7 kB | 415.0 kB | [list of files] |
| s390x | 46.5 kB | 287.0 kB | [list of files] |