パッケージ: bitseq (0.7.5+dfsg-5)

bitseq に関するリンク

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メンテナ:

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ホームページ [github.com]

類似のパッケージ:

Bayesian Inference of Transcripts from Sequencing Data

BitSeq is an application for inferring expression levels of individual transcripts from sequencing (RNA-Seq) data and estimating differential expression (DE) between conditions. An advantage of this approach is the ability to account for both technical uncertainty and intrinsic biological variance in order to avoid false DE calls. The technical contribution to the uncertainty comes both from finite read-depth and the possibly ambiguous mapping of reads to multiple transcripts.

その他の bitseq 関連パッケージ

依存

推奨

提案

enhances

dep: libc6 (>= 2.23)

GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
dep: libgcc1 (>= 1:3.0) [amd64, i386, mipsel, s390x]

パッケージは利用できません

dep: libgcc1 (>= 1:3.4.4) [ppc64el]

dep: libgcc1 (>= 1:3.5) [armel, armhf]

dep: libgcc1 (>= 1:4.2) [arm64, mips64el]
dep: libgomp1 (>= 6)

GCC OpenMP (GOMP) サポートライブラリ
dep: libstdc++6 (>= 5.2)

GNU 標準 C++ ライブラリ v3
dep: python3

対話式の高レベルオブジェクト指向言語 (デフォルト python3 バージョン)
dep: python3-numpy

Fast array facility to the Python 3 language
dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

圧縮ライブラリ - ランタイム

sug: samtools

processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats

bitseq のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード
アーキテクチャ	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
amd64	339.9 kB	1,875.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	299.7 kB	1,651.0 kB	[ファイル一覧]
armel	282.5 kB	1,522.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	288.6 kB	1,106.0 kB	[ファイル一覧]
i386	358.3 kB	1,906.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	329.5 kB	2,194.0 kB	[ファイル一覧]
mipsel	330.5 kB	2,052.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	339.9 kB	2,407.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	299.3 kB	1,887.0 kB	[ファイル一覧]