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Package: thesias (3.1.1-2)

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test di effetti di aplotipi in studi di associazione

L'obiettivo del programma THESIAS (Testing Haplotype Effects In Association Studies) è di eseguire analisi di associazione basate su aplotipi in individui senza legami di parentela. Questo programma è basato sul modello di massima verosimiglianza descritto in Tregouet et al. 2002 (Hum Mol Genet 2002,11: 2015-2023) ed è collegato all'algoritmo SEM (Tregouet et al. Ann Hum Genet 2004,68: 165-177). THESIAS permette la stima simultanea delle frequenze degli aplotipi e dei loro effetti associati sul fenotipo di interesse. In questo nuovo rilascio di THESIAS, possono essere studiati i risultati quantitativi, qualitativi (analisi logistica e per coppie corrispondenti), categorici e di sopravvivenza. È anche fattibile l'analisi degli aplotipi legati al cromosoma X. Possono anche essere investigati gli effetti degli aplotipi aggiustati per covariate e le interazioni aplotipo x covariata.

Tags: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c, implemented-in::java, User Interface: Command Line, interface::graphical, interface::x11, Role: Program, Purpose: Analysing, X Window System: Application

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