Paquet : thesias (3.1.1-3)

test des effets d’haplotypes dans les études d’associations

L’objectif du programme THESIAS est de réaliser des analyses d’association basées sur les haplotypes d’individus non apparentés. Ce programme est basé sur le modèle de maximum de vraisemblance décrit dans Trégouët et al. 2002 (Hum Mol Genet 2002,11 : p. 2015-2023) et est lié à l’algorithme SEM (Trégouët et al. Ann Hum Genet 2004,68 : p. 165-177). THESIAS permet d’estimer simultanément les fréquences d’haplotypes et leurs effets associés sur le phénotype étudié. Dans cette nouvelle version de THESIAS, les résultats quantitatifs, qualitatifs (analyse de comparaison par paires et logistique), catégoriels et de survie peuvent être étudiés. L’analyse d’haplotypes X est aussi réalisable. Les effets d’haplotypes en fonction de la covariance ainsi que les interactions entre haplotypes et covariance peuvent être étudiées.

Étiquettes: Domaine: Biologie, Bio-informatique, Mis en œuvre en: implemented-in::c, implemented-in::java, Interface utilisateur: Ligne de commande, interface::graphical, interface::x11, Rôle: Programme, But: Analyse, Système X Window: Application

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