all options
buster  ] [  bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Source: mash  ]

Package: mash (2.3+dfsg-6)

Links for mash

Screenshot

Debian Resources:

Download Source Package mash:

Maintainers:

External Resources:

Similar packages:

veloce stima di distanze in genoma e metagenoma usando MinHash

Mash usa gli hash MinHash sensibili localmente per ridurre grandi biosequenze in sketch rappresentativi e stimare rapidamente le distanze di coppia tra genomi o metagenomi. I database di sketch di Mash delineano in maniera efficace i confini conosciuti tra le specie, permettono la costruzione di filogenie approssimate e possono essere cercati in secondi usando genomi assemblati o risultati grezzi di sequenziamento da Illumina, Pacific Biosciences e Oxford Nanopore. Per la metagenomica, Mash scala fino a migliaia di campioni e può replicare i risultati dello Human Microbiome Project e del Global Ocean Survey in una frazione del tempo.

Other Packages Related to mash

  • depends
  • recommends
  • suggests
  • enhances

Download mash

Download for all available architectures
Architecture Package Size Installed Size Files
amd64 189.6 kB549.0 kB [list of files]
arm64 166.5 kB489.0 kB [list of files]
mips64el 166.8 kB636.0 kB [list of files]
ppc64el 186.5 kB617.0 kB [list of files]
s390x 185.6 kB545.0 kB [list of files]