Package: r-cran-ape (5.8-1) [debports]
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- Homepage [cran.r-project.org]
Similar packages:
pacchetto GNU R per analisi su filogenesi ed evoluzione
Questo pacchetto fornisce funzioni per leggere, scrivere, disegnare e manipolare alberi filogenetici, analisi di dati comparativi in un'infrastruttura filogenetica, analisi di caratteri ancestrali, analisi di diversificazione e macroevoluzione, calcoli di distanze da sequenze di DNA, lettura e scrittura di sequenze nucleotidiche oltre all'importazione da BioConductor e svariati strumenti come il test di Mantel, grafici skyline generalizzati, esplorazioni grafiche di dati filogenetici (alex, trex, kronoviz), stime di tassi evolutivi assoluti e alberi in stile orologio usando lunghezze di percorsi medi e verosimiglianza con penalità, traduzione di DNA in sequenze di AA e valutazione di allineamenti di sequenze. Le stime filogenetiche possono essere fatte con i metodi NJ, BIONJ, ME, MVR, SDM e triangolare e svariati metodi gestiscono matrici di distanze non complete (NJ*, BIONJ*, MVR* e il corrispondente metodo triangolare). Alcune funzioni chiamano applicazioni esterne (PhyML, Clustal, T-Coffee, Muscle) i cui risultati vengono restituiti ad R.
Other Packages Related to r-cran-ape
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- dep: libc6 (>= 2.29)
- Libreria C GNU: librerie condivise
also a virtual package provided by libc6-udeb
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- dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1)
- libreria di supporto a GCC
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- dep: liblapack3
- libreria di routine per l'algebra lineare 3 - versione condivisa
- or liblapack.so.3
- virtual package provided by libatlas3-base, liblapack3, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial
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- dep: libstdc++6 (>= 13.1)
- libreria GNU Standard C++, versione 3
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- dep: r-api-4.0
- virtual package provided by r-base-core
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- dep: r-cran-digest
- pacchetto GNU R per "hash digest" di strutture dati di R
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- dep: r-cran-lattice
- pacchetto GNU R per grafici "Trellis"
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- dep: r-cran-nlme
- pacchetto GNU R per modelli a effetti misti (non) lineari
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- dep: r-cran-rcpp (>= 0.12.0)
- pacchetto GNU R per integrazione perfetta tra R e C++
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- rec: r-cran-phangorn
- GNU R package for phylogenetic analysis
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- sug: clustalw
- allineamento globale per sequenze multiple di nucleotidi o peptidi
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- sug: muscle
- programma per allineamenti multipli di sequenze proteiche
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- sug: phyml
- stime filogenetiche usando il metodo della massima verosimiglianza
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- sug: r-cran-expm
- calcolo dell'esponenziale di matrice e valori correlati per GNU R
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- sug: r-cran-gee
- risolutore di equazioni di stima generalizzate
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- sug: r-cran-igraph
- analisi e visualizzazione di reti per GNU R
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- sug: t-coffee
- allineamento di sequenze multiple
Download r-cran-ape
| Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
|---|---|---|---|
| m68k (unofficial port) | 2,831.6 kB | 3,644.0 kB | [list of files] |