Package: bowtie2 (2.3.4.3-1)
Links for bowtie2
Debian Resources:
Download Source Package bowtie2:
Maintainers:
- Debian Med Packaging Team (QA Page, Mail Archive)
- Alexandre Mestiashvili (QA Page)
- Andreas Tille (QA Page)
External Resources:
- Homepage [bowtie-bio.sourceforge.net]
Similar packages:
allineatore di letture brevi ultraveloce ed efficiente
Uno strumento ultraveloce che usa la memoria in maniera efficiente per allineare letture di sequenziamento a sequenze lunghe di riferimento. È particolarmente adatto per allineare letture da circa 50 fino a centinaia o migliaia di caratteri e particolarmente adatto per allineare a genomi relativamente lunghi (es. mammiferi).
Bowtie 2 indicizza il genoma con un indice FM per mantenere bassa l'impronta di memoria: per il genoma umano, la sua impronta di memoria è tipicamente intorno a 3,2 GB. Bowtie 2 gestisce le modalità di allineamento con gap, locali e a estremità accoppiate.
Other Packages Related to bowtie2
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- dep: libc6 (>= 2.14)
- Libreria C GNU: librerie condivise
also a virtual package provided by libc6-udeb
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- dep: libgcc1 (>= 1:3.0)
- libreria di supporto a GCC
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- dep: libstdc++6 (>= 5.2)
- libreria GNU Standard C++, versione 3
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- dep: libtbb2
- libreria per parallelismo per C++ -- file runtime
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- dep: python
- linguaggio interattivo di alto livello orientato agli oggetti (versione Python 2)
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- dep: zlib1g (>= 1:1.2.6)
- libreria di compressione - runtime
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- sug: bowtie2-examples
- esempi per bowtie2
Download bowtie2
Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
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amd64 | 1,160.1 kB | 5,052.0 kB | [list of files] |