Package: fastqtl (2.184+dfsg-6 and others)

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Homepage [fastqtl.sourceforge.net]

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mappatore Quantitative Trait Loci (QTL) in cis per fenotipi molecolari

L'obiettivo di FastQTL è di identificare polimorfismi a nucleotide singolo (SNP) che sono associati in maniera significativa a vari fenotipi molecolari (cioè espressioni di geni conosciuti, livelli di metilazione della citosina, ecc.). Esegue scansioni per tutte le possibili coppie fenotipo-variante in cis (cioè varianti localizzate all'interno di una finestra specifica intorno a un fenotipo). FastQTL implementa un nuovo schema di permutazione (approssimazione Beta) per correggere accuratamente e velocemente test multipli sia a livello di genotipo sia di fenotipo.

Tags: Field: Biology, Bioinformatics, User Interface: interface::commandline, role::program, Purpose: Analysing

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dep: libboost-program-options1.67.0

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Libreria C GNU: librerie condivise
also a virtual package provided by libc6-udeb
dep: libgcc1 (>= 1:3.0)

libreria di supporto a GCC
dep: libgsl23 (>= 2.5)

GNU Scientific Library (GSL) -- pacchetto della libreria
dep: libhts2 (>= 1.0)

libreria C per formati di dati di sequenziamento ad alte prestazioni
dep: libstdc++6 (>= 5.2)

libreria GNU Standard C++, versione 3
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libreria matematica autonoma di GNU R
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

libreria di compressione - runtime

sug: fastqtl-doc

mappatore QTL in cis per fenotipi molecolari - documentazione

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Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
arm64	2.184+dfsg-6+b1	169.4 kB	609.0 kB	[list of files]