Paket: fastqtl (2.184+dfsg-6 und andere)

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Homepage [fastqtl.sourceforge.net]

Quantitative Trait Loci (QTL) mapper in cis for molecular phenotypes

The goal of FastQTL is to identify single-nucleotide polymorphisms (SNPs) which are significantly associated with various molecular phenotypes (i.e. expression of known genes, cytosine methylation levels, etc). It performs scans for all possible phenotype-variant pairs in cis (i.e. variants located within a specific window around a phenotype). FastQTL implements a new permutation scheme (Beta approximation) to accurately and rapidly correct for multiple-testing at both the genotype and phenotype levels.

Markierungen: Feld: Biologie, Bioinformatik, Benutzer-Schnittstellen: interface::commandline, role::program, Zweck: Analyse

Andere Pakete mit Bezug zu fastqtl

hängt ab von

empfiehlt

schlägt vor

erweitert

dep: libblas3

Grundlegende Unterprogramme für Lineare Algebra, gemeinsame Bibliothek

oder libblas.so.3

virtuelles Paket, bereitgestellt durch libatlas3-base, libblas3, libblis2-openmp, libblis2-pthread, libblis2-serial, libopenblas-base
dep: libboost-iostreams1.67.0

Boost.Iostreams-Bibliothek
dep: libboost-program-options1.67.0

C++-Bibliothek für Programmoptionen
dep: libc6 (>= 2.25)

GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb
dep: libgcc1 (>= 1:3.0)

GCC Support-Bibliothek
dep: libgsl23 (>= 2.5)

GNU Scientific Library -- Bibliothekspaket
dep: libhts2 (>= 1.0)

C-Bibliothek für Hochdurchsatz-Sequenzierungsdatenformate
dep: libstdc++6 (>= 5.2)

GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)
dep: r-mathlib

Eigenständige Mathematikbibliothek für GNU R
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

Kompressions-Bibliothek - Laufzeit

sug: fastqtl-doc

QTL mapper in cis for molecular phenotypes - documentation

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Architektur	Version	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
arm64	2.184+dfsg-6+b1	169,4 kB	609,0 kB	[Liste der Dateien]