[ Source: murasaki ]
Package: murasaki (1.68.6-12)
Links for murasaki
Debian Resources:
Download Source Package murasaki:
- [murasaki_1.68.6-12.dsc]
- [murasaki_1.68.6.orig-debian-tests-data.tar.gz]
- [murasaki_1.68.6.orig.tar.gz]
- [murasaki_1.68.6-12.debian.tar.xz]
Maintainers:
External Resources:
- Homepage [murasaki.dna.bio.keio.ac.jp]
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strumento per rilevazione di omologie tra più genomi vasti
Murasaki è uno strumento per la rilevazione di omologie in più genomi vasti veloce e basato sulla teoria del linguaggio. Permette allineamenti globali multipli di genomi su scala di intero genoma. Gestisce modelli di lunghezza illimitata con gap e seed e filtraggio unico basato su TF-IDF.
Murasaki è un software per allineamento ad ancore, che è
* estremamente veloce (17 ore di CPU per l'intero genoma uomo x topo (con 40 nodi: 52 minuti di orologio)) * scalabile (parallelizzabile a piacimento tra più nodi usando MPI. Anche un singolo nodo con 16 GB di RAM può gestire più di 1 Gpb di sequenza.) * con lunghezza illimitata dei modelli * tollerante alle ripetizioni * con riduzione intelligente del rumore
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- dep: libboost-filesystem1.74.0 (>= 1.74.0)
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- dep: libboost-iostreams1.74.0 (>= 1.74.0)
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- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [not armel, armhf, i386, mipsel]
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- dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, mipsel]
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- libreria GNU Standard C++, versione 3
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- dep: murasaki-common
- strumento per rilevazione di omologie tra più genomi vasti (file comuni)
Download murasaki
| Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
|---|---|---|---|
| amd64 | 509.4 kB | 3,247.0 kB | [list of files] |
| arm64 | 445.1 kB | 2,871.0 kB | [list of files] |
| armel | 369.5 kB | 2,377.0 kB | [list of files] |
| armhf | 378.9 kB | 1,689.0 kB | [list of files] |
| i386 | 526.6 kB | 3,105.0 kB | [list of files] |
| mips64el | 481.2 kB | 3,955.0 kB | [list of files] |
| mipsel | 474.4 kB | 3,599.0 kB | [list of files] |
| ppc64el | 504.5 kB | 4,235.0 kB | [list of files] |
| s390x | 451.1 kB | 3,355.0 kB | [list of files] |