パッケージ: murasaki (1.68.6-12)

murasaki に関するリンク

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murasaki ソースパッケージをダウンロード:

メンテナ:

外部の資源:

ホームページ [murasaki.dna.bio.keio.ac.jp]

類似のパッケージ:

homology detection tool across multiple large genomes

Murasaki is a scalable and fast, language theory-based homology detection tool across multiple large genomes. It enable whole-genome scale multiple genome global alignments. Supports unlimited length gapped-seed patterns and unique TF-IDF based filtering.

Murasaki is an anchor alignment software, which is

 * exteremely fast (17 CPU hours for whole Human x Mouse genome (with
   40 nodes: 52 wall minutes))
 * scalable (Arbitrarily parallelizable across multiple nodes using MPI.
   Even a single node with 16GB of ram can handle over 1Gbp of sequence.)
 * unlimited pattern length
 * repeat tolerant
 * intelligent noise reduction

その他の murasaki 関連パッケージ

依存

推奨

提案

enhances

dep: libboost-filesystem1.74.0 (>= 1.74.0)

C++ でのファイルシステム操作 (ポータブルなパス、ディレクトリの列挙など)
dep: libboost-iostreams1.74.0 (>= 1.74.0)

Boost.Iostreams ライブラリ
dep: libboost-regex1.74.0-icu67

以下のパッケージによって提供される仮想パッケージです: libboost-regex1.74.0
dep: libc6 (>= 2.29)

GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [armel, armhf, i386, mipsel 以外]

GCC 共有ライブラリ

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, mipsel]
dep: libstdc++6 (>= 5.2)

GNU 標準 C++ ライブラリ v3
dep: murasaki-common

homology detection tool across multiple large genomes (common files)

murasaki のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード
アーキテクチャ	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
amd64	509.4 kB	3,247.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	445.1 kB	2,871.0 kB	[ファイル一覧]
armel	369.5 kB	2,377.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	378.9 kB	1,689.0 kB	[ファイル一覧]
i386	526.6 kB	3,105.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	481.2 kB	3,955.0 kB	[ファイル一覧]
mipsel	474.4 kB	3,599.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	504.5 kB	4,235.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	451.1 kB	3,355.0 kB	[ファイル一覧]