Paquet : dascrubber (1.1-4 et autres)

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Ressources externes :

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Paquets similaires :

alignment-based scrubbing pipeline for DNA sequencing reads

The Dazzler Scrubbing Suite produces a set of edited reads that are guaranteed to

 * be continuous stretches of the underlying genome (i.e. no unremoved
   adapters and not chimers)
 * have no very low quality stretches (i.e. the error rate never exceeds some
   reasonable maximum, 20% or so in the case of Pacbio data).

Its secondary goal is to do so with the minimum removal of data and splitting of reads.

Autres paquets associés à dascrubber

dépendances

recommandations

suggestions

enhances

dep: libc6 (>= 2.16) [x32]

bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.17) [ppc64el]

dep: libc6 (>= 2.31) [sh4]

dep: libc6 (>= 2.34) [arm64, riscv64]

dep: libc6 (>= 2.7) [non alpha, arm64, ia64, ppc64el, riscv64, sh4, x32]
dep: libc6.1 (>= 2.31) [ia64]

bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.7) [alpha]

sug: daligner

alignements locaux parmi des lectures longues de séquençages de nucléotide
sug: dazzdb

manage nucleotide sequencing read data

Télécharger dascrubber

Télécharger pour toutes les architectures proposées
Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
alpha (portage non officiel)	1.1-4	159,8 ko	1 381,0 ko	[liste des fichiers]
amd64	1.1-4	163,9 ko	1 185,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	1.1-4+b1	155,0 ko	1 534,0 ko	[liste des fichiers]
armel	1.1-4	139,8 ko	1 139,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	1.1-4	137,6 ko	803,0 ko	[liste des fichiers]
hppa (portage non officiel)	1.1-4	150,4 ko	1 169,0 ko	[liste des fichiers]
i386	1.1-4	157,6 ko	1 327,0 ko	[liste des fichiers]
ia64 (portage non officiel)	1.1-4	185,4 ko	2 282,0 ko	[liste des fichiers]
m68k (portage non officiel)	1.1-4	141,1 ko	1 139,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	1.1-4	135,7 ko	1 217,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64 (portage non officiel)	1.1-4	154,2 ko	1 725,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	1.1-4	165,7 ko	1 789,0 ko	[liste des fichiers]
riscv64	1.1-4+b1	166,3 ko	930,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	1.1-4	155,1 ko	1 237,0 ko	[liste des fichiers]
sh4 (portage non officiel)	1.1-4	159,6 ko	999,0 ko	[liste des fichiers]
sparc64 (portage non officiel)	1.1-4	130,1 ko	1 159,0 ko	[liste des fichiers]
x32 (portage non officiel)	1.1-4	158,9 ko	1 151,0 ko	[liste des fichiers]