Paquet : daligner (1.0+git20240119.335105d-3 et autres)

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alignements locaux parmi des lectures longues de séquençages de nucléotide

Ces outils permettent de trouver tous les alignements locaux significatifs parmi des lectures encodées dans une base de données Dazzler. L’hypothèse est que les lectures sont originaires d’un séquenceur à lectures longues RS II de Pacific Biosciences. C'est-à-dire que les lectures sont longues et bruitées, jusqu’à 15 % en moyenne.

Étiquettes: Mis en œuvre en: C, Interface utilisateur: Ligne de commande, Rôle: Programme

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dépendances

recommandations

suggestions

enhances

dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.38) [non alpha, ia64, sh4]
dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

sug: dascrubber

alignment-based scrubbing pipeline for DNA sequencing reads
sug: dazzdb

manage nucleotide sequencing read data

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Télécharger pour toutes les architectures proposées
Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
alpha (portage non officiel)	1.0+git20240119.335105d-3	213,8 ko	1 994,0 ko	[liste des fichiers]
amd64	1.0+git20240119.335105d-3	236,0 ko	1 626,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	1.0+git20240119.335105d-3+b1	208,1 ko	1 931,0 ko	[liste des fichiers]
armel	1.0+git20240119.335105d-3	198,3 ko	1 520,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	1.0+git20240119.335105d-3	198,1 ko	1 128,0 ko	[liste des fichiers]
hppa (portage non officiel)	1.0+git20240119.335105d-3	213,7 ko	1 554,0 ko	[liste des fichiers]
i386	1.0+git20240119.335105d-3	227,6 ko	1 756,0 ko	[liste des fichiers]
ia64 (portage non officiel)	1.0+git20240119.335105d-2	252,4 ko	2 877,0 ko	[liste des fichiers]
m68k (portage non officiel)	1.0+git20240119.335105d-3	201,1 ko	1 472,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	1.0+git20240119.335105d-3	195,5 ko	2 039,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64 (portage non officiel)	1.0+git20240119.335105d-3	219,7 ko	2 250,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	1.0+git20240119.335105d-3	231,4 ko	2 186,0 ko	[liste des fichiers]
riscv64	1.0+git20240119.335105d-3	226,8 ko	1 238,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	1.0+git20240119.335105d-3	240,3 ko	1 788,0 ko	[liste des fichiers]
sh4 (portage non officiel)	1.0+git20240119.335105d-3	228,8 ko	1 664,0 ko	[liste des fichiers]
sparc64 (portage non officiel)	1.0+git20240119.335105d-3	188,4 ko	10 454,0 ko	[liste des fichiers]
x32 (portage non officiel)	1.0+git20240119.335105d-3	234,2 ko	1 556,0 ko	[liste des fichiers]