Paketti: dascrubber (1.1-4 ja muut)

Links for dascrubber

Debian-palvelut:

Imuroi lähdekoodipaketti dascrubber:

Ylläpitäjät:

External Resources:

Kotisivu [dazzlerblog.wordpress.com]

Samankaltaisia paketteja:

alignment-based scrubbing pipeline for DNA sequencing reads

The Dazzler Scrubbing Suite produces a set of edited reads that are guaranteed to

 * be continuous stretches of the underlying genome (i.e. no unremoved
   adapters and not chimers)
 * have no very low quality stretches (i.e. the error rate never exceeds some
   reasonable maximum, 20% or so in the case of Pacbio data).

Its secondary goal is to do so with the minimum removal of data and splitting of reads.

Muut pakettiin dascrubber liittyvät paketit

depends

recommends

suggests

enhances

dep: libc6 (>= 2.16) [x32]

GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.17) [ppc64el]

dep: libc6 (>= 2.31) [sh4]

dep: libc6 (>= 2.34) [arm64, riscv64]

dep: libc6 (>= 2.7) [ei alpha, arm64, ia64, ppc64el, riscv64, sh4, x32]
dep: libc6.1 (>= 2.31) [ia64]

GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.7) [alpha]

sug: daligner

local alignment discovery between long nucleotide sequencing reads
sug: dazzdb

manage nucleotide sequencing read data

Imuroi dascrubber

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille
Arkkitehtuuri	Versio	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
alpha (epävirallinen siirros)	1.1-4	159.8 kt	1,381.0 kt	[tiedostoluettelo]
amd64	1.1-4	163.9 kt	1,185.0 kt	[tiedostoluettelo]
arm64	1.1-4+b1	155.0 kt	1,534.0 kt	[tiedostoluettelo]
armel	1.1-4	139.8 kt	1,139.0 kt	[tiedostoluettelo]
armhf	1.1-4	137.6 kt	803.0 kt	[tiedostoluettelo]
hppa (epävirallinen siirros)	1.1-4	150.4 kt	1,169.0 kt	[tiedostoluettelo]
i386	1.1-4	157.6 kt	1,327.0 kt	[tiedostoluettelo]
ia64 (epävirallinen siirros)	1.1-4	185.4 kt	2,282.0 kt	[tiedostoluettelo]
m68k (epävirallinen siirros)	1.1-4	141.1 kt	1,139.0 kt	[tiedostoluettelo]
mips64el	1.1-4	135.7 kt	1,217.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64 (epävirallinen siirros)	1.1-4	154.2 kt	1,725.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64el	1.1-4	165.7 kt	1,789.0 kt	[tiedostoluettelo]
riscv64	1.1-4+b1	166.3 kt	930.0 kt	[tiedostoluettelo]
s390x	1.1-4	155.1 kt	1,237.0 kt	[tiedostoluettelo]
sh4 (epävirallinen siirros)	1.1-4	159.6 kt	999.0 kt	[tiedostoluettelo]
sparc64 (epävirallinen siirros)	1.1-4	130.1 kt	1,159.0 kt	[tiedostoluettelo]
x32 (epävirallinen siirros)	1.1-4	158.9 kt	1,151.0 kt	[tiedostoluettelo]