Paquet : daligner (1.0+git20240119.335105d-2)

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Paquets similaires :

alignements locaux parmi des lectures longues de séquençages de nucléotide

Ces outils permettent de trouver tous les alignements locaux significatifs parmi des lectures encodées dans une base de données Dazzler. L’hypothèse est que les lectures sont originaires d’un séquenceur à lectures longues RS II de Pacific Biosciences. C'est-à-dire que les lectures sont longues et bruitées, jusqu’à 15 % en moyenne.

Étiquettes: Mis en œuvre en: C, Interface utilisateur: Ligne de commande, Rôle: Programme

Autres paquets associés à daligner

dépendances

recommandations

suggestions

enhances

dep: libc6 (>= 2.34)

bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

sug: dascrubber

alignment-based scrubbing pipeline for DNA sequencing reads
sug: dazzdb

manage nucleotide sequencing read data

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Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	235,7 ko	1 626,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	206,7 ko	1 928,0 ko	[liste des fichiers]
armel	198,1 ko	1 520,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	198,1 ko	1 128,0 ko	[liste des fichiers]
i386	227,8 ko	1 756,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	195,6 ko	2 039,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	231,2 ko	2 186,0 ko	[liste des fichiers]
riscv64	225,9 ko	1 238,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	240,1 ko	1 788,0 ko	[liste des fichiers]