Paquet : ariba (2.13.3+ds-1)

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identification de résistance antibiotique par assemblage

ARIBA est un outil identifiant les gènes de résistance antibiotique en lançant des assemblages locaux. L'entrée est un fichier FASTA de gènes de référence et de lectures de séquençages appairés. ARIBA rapporte les gènes de référence trouvés ainsi que des informations supplémentaires sur la qualité des assemblages et de toutes les variantes entre les lectures de séquençage et les gènes de référence.

Étiquettes: Biologie: Acides nucléiques, Domaine: Biologie, field::biology:bioinformatics, implemented-in::python, Interface utilisateur: Ligne de commande, Rôle: role::program, scope::application, But: Analyse

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