Paketti: maq (0.7.1-9 ja muut)

Links for maq

Debian-palvelut:

Imuroi lähdekoodipaketti maq:

Ylläpitäjät:

External Resources:

Kotisivu [maq.sourceforge.net]

Samankaltaisia paketteja:

maps short fixed-length polymorphic DNA sequence reads to reference sequences

Maq (short for Mapping and Assembly with Quality) builds mapping assemblies from short reads generated by the next-generation sequencing machines. It was particularly designed for Illumina-Solexa 1G Genetic Analyzer, and has a preliminary functionality to handle ABI SOLiD data. Maq is previously known as mapass2.

Developmemt of Maq stopped in 2008. Its successors are BWA and SAMtools.

Tagit: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c++, implemented-in::perl, User Interface: Command Line, Role: role::program, scope::utility, Purpose: Need an extra tag, Analysing, use::comparing, use::searching, Supports Format: Need an extra tag, works-with-format::plaintext, works-with::TODO

Muut pakettiin maq liittyvät paketit

depends

recommends

suggests

enhances

dep: libc6 (>= 2.29) [ei alpha, ia64, riscv64, sh4]

GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.31) [sh4]

dep: libc6 (>= 2.34) [riscv64]
dep: libc6.1 (>= 2.29) [alpha]

GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.31) [ia64]
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [sparc64]

GCC:n apukirjasto

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [arm64, i386, ia64, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, sh4]
dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

GCC:n apukirjasto
dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

GCC:n apukirjasto
dep: libstdc++6 (>= 5)

GNU standardi C++ -kirjasto, versio 3
dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

pakkauskirjaston ajonaikaistiedostot

sug: bwa

Burrows-Wheeler Aligner
sug: samtools

processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats

Imuroi maq

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille
Arkkitehtuuri	Versio	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
alpha (epävirallinen siirros)	0.7.1-9	304.7 kt	584.0 kt	[tiedostoluettelo]
amd64	0.7.1-9	295.7 kt	543.0 kt	[tiedostoluettelo]
arm64	0.7.1-9	286.7 kt	519.0 kt	[tiedostoluettelo]
armel	0.7.1-9	285.5 kt	530.0 kt	[tiedostoluettelo]
armhf	0.7.1-9	286.9 kt	474.0 kt	[tiedostoluettelo]
hppa (epävirallinen siirros)	0.7.1-9	309.5 kt	559.0 kt	[tiedostoluettelo]
i386	0.7.1-9	306.2 kt	575.0 kt	[tiedostoluettelo]
ia64 (epävirallinen siirros)	0.7.1-9	329.5 kt	752.0 kt	[tiedostoluettelo]
m68k (epävirallinen siirros)	0.7.1-9	297.1 kt	558.0 kt	[tiedostoluettelo]
mips64el	0.7.1-9	296.9 kt	578.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64 (epävirallinen siirros)	0.7.1-9	301.7 kt	647.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64el	0.7.1-9	304.8 kt	647.0 kt	[tiedostoluettelo]
riscv64	0.7.1-9+b1	298.6 kt	498.0 kt	[tiedostoluettelo]
s390x	0.7.1-9	288.4 kt	547.0 kt	[tiedostoluettelo]
sh4 (epävirallinen siirros)	0.7.1-9	318.8 kt	527.0 kt	[tiedostoluettelo]
sparc64 (epävirallinen siirros)	0.7.1-9	289.3 kt	546.0 kt	[tiedostoluettelo]
x32 (epävirallinen siirros)	0.7.1-9	295.1 kt	539.0 kt	[tiedostoluettelo]