Пакет: maq (0.7.1-9 и другие)

Ссылки для maq

Ресурсы Debian:

Исходный код maq:

Сопровождающие:

Внешние ресурсы:

Сайт [maq.sourceforge.net]

Подобные пакеты:

maps short fixed-length polymorphic DNA sequence reads to reference sequences

Maq (short for Mapping and Assembly with Quality) builds mapping assemblies from short reads generated by the next-generation sequencing machines. It was particularly designed for Illumina-Solexa 1G Genetic Analyzer, and has a preliminary functionality to handle ABI SOLiD data. Maq is previously known as mapass2.

Developmemt of Maq stopped in 2008. Its successors are BWA and SAMtools.

Теги: Область: Биология, Биоинформатика, Реализовано на: implemented-in::c++, implemented-in::perl, Пользовательский интерфейс: Командная строка, Роль: role::program, scope::utility, Цель: Требуется дополнительный тег, Анализ, use::comparing, use::searching, Поддерживаемые форматы: Требуется дополнительный тег, works-with-format::plaintext, works-with::TODO

Другие пакеты, относящиеся к maq

зависимости

рекомендации

предложения

enhances

dep: libc6 (>= 2.29) [не alpha, ia64, riscv64, sh4]

библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.31) [sh4]

dep: libc6 (>= 2.34) [riscv64]
dep: libc6.1 (>= 2.29) [alpha]

библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.31) [ia64]
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [sparc64]

вспомогательная библиотека GCC

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [arm64, i386, ia64, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, sh4]
dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

вспомогательная библиотека GCC
dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

вспомогательная библиотека GCC
dep: libstdc++6 (>= 5)

стандартная библиотека GNU C++ версии 3
dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

библиотека сжатия

sug: bwa

Burrows-Wheeler Aligner
sug: samtools

processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats

Загрузка maq

Загрузить для всех доступных архитектур
Архитектура	Версия	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
alpha (неофициальный перенос)	0.7.1-9	304,7 Кб	584,0 Кб	[список файлов]
amd64	0.7.1-9	295,7 Кб	543,0 Кб	[список файлов]
arm64	0.7.1-9	286,7 Кб	519,0 Кб	[список файлов]
armel	0.7.1-9	285,5 Кб	530,0 Кб	[список файлов]
armhf	0.7.1-9	286,9 Кб	474,0 Кб	[список файлов]
hppa (неофициальный перенос)	0.7.1-9	309,5 Кб	559,0 Кб	[список файлов]
i386	0.7.1-9	306,2 Кб	575,0 Кб	[список файлов]
ia64 (неофициальный перенос)	0.7.1-9	329,5 Кб	752,0 Кб	[список файлов]
m68k (неофициальный перенос)	0.7.1-9	297,1 Кб	558,0 Кб	[список файлов]
mips64el	0.7.1-9	296,9 Кб	578,0 Кб	[список файлов]
ppc64 (неофициальный перенос)	0.7.1-9	301,7 Кб	647,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	0.7.1-9	304,8 Кб	647,0 Кб	[список файлов]
riscv64	0.7.1-9+b1	298,6 Кб	498,0 Кб	[список файлов]
s390x	0.7.1-9	288,4 Кб	547,0 Кб	[список файлов]
sh4 (неофициальный перенос)	0.7.1-9	318,8 Кб	527,0 Кб	[список файлов]
sparc64 (неофициальный перенос)	0.7.1-9	289,3 Кб	546,0 Кб	[список файлов]
x32 (неофициальный перенос)	0.7.1-9	295,1 Кб	539,0 Кб	[список файлов]