Paketti: bwa (0.7.17-7 ja muut)

Links for bwa

Debian-palvelut:

Imuroi lähdekoodipaketti bwa:

Ylläpitäjät:

External Resources:

Kotisivu [bio-bwa.sourceforge.net]

Samankaltaisia paketteja:

Burrows-Wheeler Aligner

BWA is a software package for mapping low-divergent sequences against a large reference genome, such as the human genome. It consists of three algorithms: BWA-backtrack, BWA-SW and BWA-MEM. The first algorithm is designed for Illumina sequence reads up to 100bp, while the rest two for longer sequences ranged from 70bp to 1Mbp. BWA-MEM and BWA-SW share similar features such as long-read support and split alignment, but BWA-MEM, which is the latest, is generally recommended for high-quality queries as it is faster and more accurate. BWA-MEM also has better performance than BWA-backtrack for 70-100bp Illumina reads.

Tagit: Biology: Proteins, Field: Biology, field::biology:bioinformatics, implemented-in::c, User Interface: Command Line, interface::text-mode, role::program, Purpose: Analysing, Comparing

Muut pakettiin bwa liittyvät paketit

depends

recommends

suggests

enhances

dep: libc6 (>= 2.34) [ei alpha, ia64, sh4]

GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]
dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

pakkauskirjaston ajonaikaistiedostot

rec: perl

Larry Wallin kieli tekstitiedostojen analysointia ja raportointia varten

sug: samtools

processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats

Imuroi bwa

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille
Arkkitehtuuri	Versio	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
alpha (epävirallinen siirros)	0.7.17-7+b5	206.9 kt	513.0 kt	[tiedostoluettelo]
amd64	0.7.17-7+b3	207.3 kt	453.0 kt	[tiedostoluettelo]
arm64	0.7.17-7+b3	189.1 kt	449.0 kt	[tiedostoluettelo]
armel	0.7.17-7+b3	190.8 kt	432.0 kt	[tiedostoluettelo]
armhf	0.7.17-7+b3	190.0 kt	320.0 kt	[tiedostoluettelo]
hppa (epävirallinen siirros)	0.7.17-7+b3	226.4 kt	513.0 kt	[tiedostoluettelo]
i386	0.7.17-7+b3	230.1 kt	520.0 kt	[tiedostoluettelo]
ia64 (epävirallinen siirros)	0.7.17-7+b4	280.4 kt	925.0 kt	[tiedostoluettelo]
m68k (epävirallinen siirros)	0.7.17-7+b3	204.7 kt	472.0 kt	[tiedostoluettelo]
mips64el	0.7.17-7+b3	201.0 kt	528.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64 (epävirallinen siirros)	0.7.17-7+b3	218.1 kt	577.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64el	0.7.17-7+b3	228.6 kt	577.0 kt	[tiedostoluettelo]
riscv64	0.7.17-7+b3	214.5 kt	376.0 kt	[tiedostoluettelo]
s390x	0.7.17-7+b3	220.3 kt	509.0 kt	[tiedostoluettelo]
sh4 (epävirallinen siirros)	0.7.17-7+b3	273.6 kt	449.0 kt	[tiedostoluettelo]
sparc64 (epävirallinen siirros)	0.7.17-7+b3	182.7 kt	1,093.0 kt	[tiedostoluettelo]
x32 (epävirallinen siirros)	0.7.17-7+b3	218.9 kt	468.0 kt	[tiedostoluettelo]