Paketti: bwa (0.7.17-8~0exp) [debports]
Links for bwa
Debian-palvelut:
Imuroi lähdekoodipaketti :
Ei löytynytYlläpitäjät:
External Resources:
- Kotisivu [bio-bwa.sourceforge.net]
Samankaltaisia paketteja:
Kokeellinen paketti
Varoitus: Tämä paketti on kokeellisesta jakelusta. Tämä tarkoittaa, että se on luultavasti epävakaa tai buginen, ja voi aiheuttaa jopa tiedonhäviötä. Kannattaa ehdottomasti tutustua muutoslokiin ja muihin mahdollisiin ohjeisiin ennen käyttöönottoa.
Burrows-Wheeler Aligner
BWA is a software package for mapping low-divergent sequences against a large reference genome, such as the human genome. It consists of three algorithms: BWA-backtrack, BWA-SW and BWA-MEM. The first algorithm is designed for Illumina sequence reads up to 100bp, while the rest two for longer sequences ranged from 70bp to 1Mbp. BWA-MEM and BWA-SW share similar features such as long-read support and split alignment, but BWA-MEM, which is the latest, is generally recommended for high-quality queries as it is faster and more accurate. BWA-MEM also has better performance than BWA-backtrack for 70-100bp Illumina reads.
Muut pakettiin bwa liittyvät paketit
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.34) [riscv64]
- GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb
-
- dep: libc6.1 (>= 2.36) [ia64]
- GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6.1-udeb
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- pakkauskirjaston ajonaikaistiedostot
-
- rec: perl
- Larry Wallin kieli tekstitiedostojen analysointia ja raportointia varten
-
- sug: samtools
- processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats
Imuroi bwa
| Arkkitehtuuri | Paketin koko | Koko asennettuna | Tiedostot |
|---|---|---|---|
| ia64 (epävirallinen siirros) | 291.1 kt | 962.0 kt | [tiedostoluettelo] |
| riscv64 (epävirallinen siirros) | 200.8 kt | 345.0 kt | [tiedostoluettelo] |