Paketti: murasaki (1.68.6-12)

Links for murasaki

Debian-palvelut:

Imuroi lähdekoodipaketti murasaki:

Ylläpitäjät:

External Resources:

Kotisivu [murasaki.dna.bio.keio.ac.jp]

Samankaltaisia paketteja:

homology detection tool across multiple large genomes

Murasaki is a scalable and fast, language theory-based homology detection tool across multiple large genomes. It enable whole-genome scale multiple genome global alignments. Supports unlimited length gapped-seed patterns and unique TF-IDF based filtering.

Murasaki is an anchor alignment software, which is

 * exteremely fast (17 CPU hours for whole Human x Mouse genome (with
   40 nodes: 52 wall minutes))
 * scalable (Arbitrarily parallelizable across multiple nodes using MPI.
   Even a single node with 16GB of ram can handle over 1Gbp of sequence.)
 * unlimited pattern length
 * repeat tolerant
 * intelligent noise reduction

Muut pakettiin murasaki liittyvät paketit

depends

recommends

suggests

enhances

dep: libboost-filesystem1.74.0 (>= 1.74.0)

filesystem operations (portable paths, iteration over directories, etc) in C++
dep: libboost-iostreams1.74.0 (>= 1.74.0)

Boost.Iostreams -kirjasto
dep: libboost-regex1.74.0-icu67

näennäispaketti, jonka toteuttaa libboost-regex1.74.0
dep: libc6 (>= 2.29)

GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [ei armel, armhf, i386, mipsel]

GCC:n apukirjasto

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, mipsel]
dep: libstdc++6 (>= 5.2)

GNU standardi C++ -kirjasto, versio 3
dep: murasaki-common

homology detection tool across multiple large genomes (common files)

Imuroi murasaki

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille
Arkkitehtuuri	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
amd64	509.4 kt	3,247.0 kt	[tiedostoluettelo]
arm64	445.1 kt	2,871.0 kt	[tiedostoluettelo]
armel	369.5 kt	2,377.0 kt	[tiedostoluettelo]
armhf	378.9 kt	1,689.0 kt	[tiedostoluettelo]
i386	526.6 kt	3,105.0 kt	[tiedostoluettelo]
mips64el	481.2 kt	3,955.0 kt	[tiedostoluettelo]
mipsel	474.4 kt	3,599.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64el	504.5 kt	4,235.0 kt	[tiedostoluettelo]
s390x	451.1 kt	3,355.0 kt	[tiedostoluettelo]