Package: bitseq (0.7.5+dfsg-6)

Links for bitseq

Debian Resources:

Download Source Package bitseq:

Maintainers:

Debian Med Packaging Team (QA Page, Mail Archive)
Tim Booth (QA Page)
Andreas Tille (QA Page)

External Resources:

Homepage [github.com]

Similar packages:

Bayesiansk udledning af transkripter fra sekvensdata

BitSeq er et program til at udlede udtryksniveauer på individuelle transkripter fra sekvensdata (RNA-Seq) og estimering af differentiel udtryk (DE) mellem betingelser. En fordel ved denne fremgangsmåde er muligheden for at tage højde for både teknisk usikkerhed og iboende biologisk varians for at undgå falske DE-kald. Det tekniske bidrag til usikkerheden kommer både fra den finitte læse-dybde og den mulige tvetydige kortlægning af læsninger til flere transkripter.

Other Packages Related to bitseq

depends

recommends

suggests

enhances

dep: libc6 (>= 2.29)

GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
also a virtual package provided by libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, i386, s390x]

GCC støttebibliotek

dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4) [ppc64el]

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [arm64, mips64el]
dep: libgomp1 (>= 6)

GCC OpenMP-understøttelsesbibliotek (GOMP)
dep: libstdc++6 (>= 5.2)

GNU Standard C++ bibliotek v3
dep: python3

Interaktivt objektorienteret højniveausprog - standardversion af Python 3
dep: python3-numpy

Hurtig tabelfacilitet til Python 3-sproget
dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

Komprimeringsbibliotek - kørselstid

sug: samtools

Forarbejdning af sekvensopstillinger i SAM-, BAM- og CRAM-formater

Download bitseq

Download for all available architectures
Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	337.2 kB	1,927.0 kB	[list of files]
arm64	298.0 kB	1,691.0 kB	[list of files]
armel	282.4 kB	1,606.0 kB	[list of files]
armhf	286.8 kB	1,158.0 kB	[list of files]
i386	362.5 kB	2,022.0 kB	[list of files]
mips64el	320.9 kB	2,167.0 kB	[list of files]
ppc64el	343.5 kB	2,471.0 kB	[list of files]
s390x	297.6 kB	1,955.0 kB	[list of files]