Package: optimir (1.2-2)

Links for optimir

Debian Resources:

Download Source Package optimir:

Maintainers:

External Resources:

Homepage [github.com]

Similar packages:

Integration af genetiske varianter i miRNA-sammenligning

OptimiR er et arbejdsforløb for miRSeq-datasammenligninger. Det integerer genetisk information for at kunne vurdere påvirkningen af varianter på miRNA-udtryk.

OptimiR: En bioinformatik-datakanal designet til at registrere og kvantificere miRNA'er, isomiR'er og plymiR'er fra miRSeq-data og studere påvirkningen af variationer på polymirers udtryk.

Other Packages Related to optimir

depends

recommends

suggests

enhances

dep: bowtie2

Ultrahurtig og hukommelseseffektiv short read-sammenligner
dep: cutadapt

Rens biologiske sekvenser fra sekvenslæsninger med høj gennemløb
dep: python3

Interaktivt objektorienteret højniveausprog - standardversion af Python 3
dep: python3-biopython

Python 3-bibliotek for bioinformatik
dep: python3-pysam

Grænseflade for SAM/BAM-sekvenssammenligning og oversættelsesformatet - Python 3
dep: samtools

Forarbejdning af sekvensopstillinger i SAM-, BAM- og CRAM-formater

rec: r-cran-ggplot2

Implementering af Grammar of Graphics
rec: r-cran-gridextra

GNU R-pakke med udvidelser for pakken grid

Download optimir

Download for all available architectures
Architecture	Package Size	Installed Size	Files
all	1,002.4 kB	7,403.0 kB	[list of files]