Package: stacks (2.67+dfsg-1) [debports]
Links for stacks
Debian Resources:
Download Source Package :
Not foundMaintainers:
External Resources:
- Homepage [creskolab.uoregon.edu]
Similar packages:
Datakanal for bygning af loci fra kort-læs DNA-sekvenser
Stacks er en programdatakanal for bygning af loci (specifik placering af et gen) fra kort-læs sekvenser, såsom dem oprettet på platformen Illumina. Stacks blev udviklet for at fungere med begrænsning af enzymbaserede data, såsom RAD-seq, med det formål at bygge genetiske kort og udføre forskning indenfor befolkningsgener og fylogeografi.
Bemærk at denne pakke installerer Stacks på en måde der gør, at alle kommandoer skal køres som: $ stacks <kommandonavn> <parametre>
Other Packages Related to stacks
|
|
|
|
-
- dep: bsdextrautils
- Ekstra redskaber fra 4.4BSD-Lite
-
- dep: libc6 (>= 2.38)
- GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
also a virtual package provided by libc6-udeb
-
- dep: libdbi-perl
- databasegrænseflade til Perl (DBI)
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0)
- GCC støttebibliotek
-
- dep: libgomp1 (>= 6)
- GCC OpenMP-understøttelsesbibliotek (GOMP)
-
- dep: libhts3t64 (>= 1.17)
- C-bibliotek for høj-gennemløb sekvensdataformater
-
- dep: libstdc++6 (>= 14)
- GNU Standard C++ bibliotek v3
-
- dep: python3
- Interaktivt objektorienteret højniveausprog - standardversion af Python 3
-
- dep: samtools
- Forarbejdning af sekvensopstillinger i SAM-, BAM- og CRAM-formater
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.2.6)
- Komprimeringsbibliotek - kørselstid
-
- rec: libspreadsheet-writeexcel-perl
- module to create Excel spreadsheets
-
- rec: littler
- GNU R-brugerflade for skript og kommandolinje - overgangspakke
also a virtual package provided by r-cran-littler
-
- sug: gdb
- Fejlsøgningsprogrammet GNU Debugger
also a virtual package provided by gdb-minimal
Download stacks
Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
---|---|---|---|
x32 (unofficial port) | 1,224.8 kB | 5,737.0 kB | [list of files] |